RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491749.2

EFHC1-204, Transcript of EF-hand domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EFHC1, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1-204ENST00000491749 ITFG1Q8TB96 612 aa26.61■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 DNAJC25Q9H1X3 360 aa26.61■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 ASAH2Q9NR71 780 aa26.61■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 CDH7Q9ULB5 785 aa26.61■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 ZNF197O14709 1029 aa26.6■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 PDGFRBP09619 1106 aa26.6■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 LAMP2P13473 410 aa26.6■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 VEPH1Q14D04 833 aa26.6■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 CCDC40Q4G0X9 1142 aa26.6■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 CYP4A22Q5TCH4 519 aa26.6■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 FAM171BQ6P995 826 aa26.6■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 ITIH5Q86UX2 942 aa26.6■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 FGF13Q92913 245 aa26.6■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 ELMO3Q96BJ8 720 aa26.6■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 RWDD2AQ9UIY3 292 aa26.6■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 MYBPHLA2RUH7 354 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 ATP2C2O75185 946 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 EPHA5P54756 1037 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 NOP14P78316 857 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 SLC5A9Q2M3M2 681 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 CFAP221Q4G0U5 840 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 PRSS36Q5K4E3 855 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 SPOPLQ6IQ16 392 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 C4orf50Q6ZRC1 276 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 FBXL13Q8NEE6 735 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 PSMG2Q969U7 264 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 SLC35C1Q96A29 364 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.857e-8■■■■■ 34.9
EFHC1-204ENST00000491749 PI4K2AQ9BTU6 479 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 EPHX3Q9H6B9 360 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 CRTAC1Q9NQ79 661 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 NME7Q9Y5B8 376 aa26.59■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 TRIOO75962 3097 aa26.58■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 A8MXQ7 604 aa26.58■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 GNA14O95837 355 aa26.58■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 MBD3O95983 291 aa26.58■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 ATF6P18850 670 aa26.58■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 RAP1GAPP47736 663 aa26.58■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 CDH8P55286 799 aa26.58■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 CCDC142Q17RM4 750 aa26.58■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 NPAS3Q8IXF0 933 aa26.58■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 HS6ST3Q8IZP7 471 aa26.58■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.58■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 ING5Q8WYH8 240 aa26.58■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 SORCS3Q9UPU3 1222 aa26.58■■□□□ 1.85
EFHC1-204ENST00000491749 MICAL2O94851 1124 aa26.57■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 ASGR2P07307 311 aa26.57■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 ASPAP45381 313 aa26.57■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 CBWD6Q4V339 395 aa26.57■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 CBWD3Q5JTY5 395 aa26.57■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 CBWD5Q5RIA9 395 aa26.57■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa26.57■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 MYLPFQ96A32 169 aa26.57■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 NIF3L1Q9GZT8 377 aa26.57■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 SDCBP2Q9H190 292 aa26.57■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.842e-6■■■■■ 96.1
EFHC1-204ENST00000491749 RAB20Q9NX57 234 aa26.57■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 IGSF9Q9P2J2 1179 aa26.57■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 MYL4P12829 197 aa26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 CYP2F1P24903 491 aa26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 MTMR3Q13615 1198 aa26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 TMC8Q8IU68 726 aa26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 SEMA4DQ92854 862 aa26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 NXPE3Q969Y0 559 aa26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 LPIN3Q9BQK8 851 aa26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 LRRC3Q9BY71 257 aa26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 BCO2Q9BYV7 579 aa26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 DPEP3Q9H4B8 488 aa26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 KCNK12Q9HB15 430 aa26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 GDE1Q9NZC3 331 aa26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 DACH1Q9UI36 760 aa26.56■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 FGF19O95750 216 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 CEBPBP17676 345 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 CCR2P41597 374 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 MAGEA11P43364 429 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 NLRP12P59046 1061 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 CYP27A1Q02318 531 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 DPCR1Q3MIW9 517 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 MDH1BQ5I0G3 518 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 EDAQ92838 391 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 TCEAL4Q96EI5 215 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 PCED1BQ96HM7 432 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 TNIP3Q96KP6 325 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 CYP3A43Q9HB55 503 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 COQ4Q9Y3A0 265 aa26.55■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 MARSP56192 900 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 ZXDAP98168 799 aa26.54■■□□□ 1.84
EFHC1-204ENST00000491749 TAF12Q16514 161 aa26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms