RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491274.5

SDHB-208, Transcript of succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B, humanhuman

TSL 5

Gene SDHB, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHB-208ENST00000491274 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ZNF461Q8TAF7 563 aa7.17□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.17□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 SMARCE1Q969G3 411 aa7.17□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 MMS19Q96T76 1030 aa7.17□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.17□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.17□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 POMKQ9H5K3 350 aa7.17□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 CD320Q9NPF0 282 aa7.17□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.17□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 USP3Q9Y6I4 520 aa7.17□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ANO9A1A5B4 782 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 LOC730098B7Z3J9 87 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 M0QZQ0 153 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 DCXO43602 365 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 OR4Q2P0C623 313 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 KRT13P13646 458 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ATF2P15336 505 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 TYMPP19971 482 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 FSHRP23945 695 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ALDH1A3P47895 512 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 WNT7BP56706 349 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 FOXK2Q01167 660 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ROR1Q01973 937 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 CYP24A1Q07973 514 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 BIRC3Q13489 604 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 STIM1Q13586 685 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 PSMD6Q15008 389 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 WSCD1Q658N2 575 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 TPGS2Q68CL5 300 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ISM2Q6H9L7 571 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 SLC8B1Q6J4K2 584 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 RTL10Q7L3V2 364 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 WDR49Q8IV35 697 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 C12orf56Q8IXR9 622 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 HPDLQ96IR7 371 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 TIGD1Q96MW7 591 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 PGLYRP2Q96PD5 576 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 GSDMAQ96QA5 445 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 FAM129BQ96TA1 746 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 TSG101Q99816 390 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 INTS13Q9NVM9 706 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 MUTYHQ9UIF7 546 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 TTC28Q96AY4 2481 aa7.16□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 EYSQ5T1H1 3165 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 WDR27A2RRH5 827 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 CETN3O15182 167 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ABLIM3O94929 683 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 PTPN2P17706 415 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 NR2F2P24468 414 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 HOXA9P31269 272 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 CDR1P51861 262 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 AP3M2P53677 418 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 EPHB3P54753 998 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 PTPN5P54829 565 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 UBE2HP62256 183 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 TNNC1P63316 161 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 NTHL1P78549 312 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 MYL7Q01449 175 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 TSPY1Q01534 308 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 DUSP4Q13115 394 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 GPR17Q13304 367 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ADAM9Q13443 819 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 MYBPC2Q14324 1141 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ARID5BQ14865 1188 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 TAF12Q16514 161 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ENGASEQ8NFI3 743 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 UBXN4Q92575 508 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 FAM84AQ96KN4 292 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 CGRRF1Q99675 332 aa7.15□□□□□ -1.26
SDHB-208ENST00000491274 CORO1BQ9BR76 489 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms