RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	POLD4	Q9HCU8	107 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	VTA1	Q9NP79	307 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A087X0T9	212 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TISP43	B9A030	160 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	BTBD19	C9JJ37	291 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	CES2	O00748	559 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ADCY3	O60266	1144 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	PEX10	O60683	326 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TACC1	O75410	805 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM228B	P0C875	321 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM49	P0CI25	452 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM49C	P0CI26	452 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	MXI1	P50539	228 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	IRAK1	P51617	712 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	EFNA5	P52803	228 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP27A1	Q02318	531 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	APBA1	Q02410	837 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ARHGAP1	Q07960	439 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP24A1	Q07973	514 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	CETN1	Q12798	172 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	GRB14	Q14449	540 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TTLL4	Q14679	1199 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	PSMD6	Q15008	389 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC14	Q15048	493 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR162	Q16538	588 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	GPD1L	Q8N335	351 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TCP11	Q8WWU5	503 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	SHC3	Q92529	594 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	SPAG5	Q96R06	1193 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	CARD6	Q9BX69	1037 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	DEF6	Q9H4E7	631 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF14	Q9UBS8	474 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	NCAN	O14594	1321 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	UTRN	P46939	3433 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	COL1A2	P08123	1366 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0B4J269	797 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC169	A6NNP5	214 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	PDHX	O00330	501 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ABLIM1	O14639	778 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ASAP2	O43150	1006 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP8B1	O43520	1251 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM189A1	O60320	539 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	HBP1	O60381	514 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV1-40	P01703	118 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	PGK2	P07205	417 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	HOXC6	P09630	235 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	PROZ	P22891	400 aa		5.97	□□□□□ -1.45

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