RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 SPATA18Q8TC71 538 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-212ENST00000484841 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
ACTB-212ENST00000484841 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-212ENST00000484841 MKNK1Q9BUB5 465 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-212ENST00000484841 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-212ENST00000484841 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
ACTB-212ENST00000484841 RAB23Q9ULC3 237 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-212ENST00000484841 L1RE1Q9UN81 338 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-212ENST00000484841 DENND4CQ5VZ89 1909 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-212ENST00000484841 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CHRNB1P11230 501 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CMTM8Q8IZV2 173 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 MAB21L3Q8N8X9 362 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SLC46A2Q9BY10 475 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 TRIM9Q9C026 710 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 IL21Q9HBE4 155 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 ABCB6Q9NP58 842 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 INTS13Q9NVM9 706 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 GDAP2Q9NXN4 497 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CTHP32929 405 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SOX9P48436 509 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 NLRP12P59046 1061 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 ERMP1Q7Z2K6 904 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 DCLK2Q8N568 766 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 TMLHEQ9NVH6 421 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 HSPBP1Q9NZL4 362 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 FAM186AA6NE01 2351 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 LILRB5O75023 590 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 PRAMEF12O95522 483 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 FAM26FQ5R3K3 315 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 DPH6Q7L8W6 267 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 NELL1Q92832 810 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 HPS3Q969F9 1004 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SNX21Q969T3 373 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 HPDLQ96IR7 371 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 FNBP1Q96RU3 617 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 EPC1Q9H2F5 836 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 GMEB2Q9UKD1 530 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 OBSL1O75147 1896 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SOBPA7XYQ1 873 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 TNNI1P19237 187 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CYP2F1P24903 491 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 ME1P48163 572 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 GPR15P49685 360 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 AMPD2Q01433 879 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 PON2Q15165 354 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 E2F4Q16254 413 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 DDR2Q16832 855 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 HS2ST1Q7LGA3 356 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CBWD2Q8IUF1 395 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 WDR49Q8IV35 697 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 FSIP1Q8NA03 581 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 RDH13Q8NBN7 331 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 LRRC3BQ96PB8 259 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 MMS19Q96T76 1030 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 GKN1Q9NS71 199 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 TDP1Q9NUW8 608 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 UBE4BO95155 1302 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 F11P03951 625 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 TXNDC8Q6A555 127 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SHC4Q6S5L8 630 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 EXOC4Q96A65 974 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 C7orf25Q9BPX7 421 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SIX4Q9UIU6 781 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CFAP45Q9UL16 551 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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