RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CDY2AQ9Y6F7 541 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC37AA6NMS7 1700 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 TTC41PQ6P2S7 1318 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 LTBP1Q14766 1721 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 NEMP1O14524 444 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ERC2O15083 957 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ECE2O60344 883 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SOX5P35711 763 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 IARSP41252 1262 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SESN3P58005 492 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 IGBP1P78318 339 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 UBE3CQ15386 1083 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 UGT8Q16880 541 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF627Q7L945 461 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 XYLT1Q86Y38 959 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 UBR7Q8N806 425 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA5Q8NB90 893 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 EYA3Q99504 573 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 TAOK3Q9H2K8 898 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ABCF2Q9UG63 623 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CHD4Q14839 1912 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SNED1Q8TER0 1413 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 COL4A5P29400 1685 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 AKAP11Q9UKA4 1901 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 YDJCA8MPS7 323 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM24O15164 1050 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ZEB2O60315 1214 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 IDH1O75874 414 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PDCD1Q15116 288 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 DOK3Q7L591 496 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SUPT20HQ8NEM7 779 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 OR52N2Q8NGI0 321 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ACAP3Q96P50 834 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PSMD1Q99460 953 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PRRX2Q99811 253 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 FSD1Q9BTV5 496 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PAG1Q9NWQ8 432 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 RAI14Q9P0K7 980 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 EDARQ9UNE0 448 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PRKAB1Q9Y478 270 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 MED23Q9ULK4 1368 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ARAP2Q8WZ64 1704 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM191CA6NGB0 347 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 RAMP2O60895 175 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM127O75204 238 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PPFIA4O75335 1185 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ITGA10O75578 1167 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 IL1R1P14778 569 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 TGM1P22735 817 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PRDX5P30044 214 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 INHBEP58166 350 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 APBA1Q02410 837 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 AOX1Q06278 1338 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SCN9AQ15858 1988 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 BMP2KLQ5H9B9 411 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 MFSD14BQ5SR56 506 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 TTLL5Q6EMB2 1281 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 KCNV1Q6PIU1 500 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ABHD15Q6UXT9 468 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CNTROBQ8N137 903 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CERS5Q8N5B7 392 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 MAGEB6Q8N7X4 407 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PROKR1Q8TCW9 393 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SNX33Q8WV41 574 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 JDP2Q8WYK2 163 aa5.61□□□□□ -1.51
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