RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482107.1

FNBP1-208, Transcript of formin binding protein 1, human

TSL 3

Gene FNBP1, Length 334 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FNBP1-208	ENST00000482107	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	LRPAP1	P30533	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	SOX5	P35711	763 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	PNPLA4	P41247	253 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	STAT1	P42224	750 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	GJA8	P48165	433 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	GCLM	P48507	274 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	ACOT2	P49753	483 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	KLK7	P49862	253 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	MFAP3	P55082	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	BPIFB4	P59827	614 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	KRT83	P78385	493 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	FAM189B	P81408	668 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	BFSP2	Q13515	415 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	NCOA4	Q13772	614 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	APBB2	Q92870	758 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	WNT8B	Q93098	351 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	CARNS1	A5YM72	827 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	RECQL4	O94761	1208 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	EOMES	O95936	686 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	TNNC2	P02585	160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	CXCL8	P10145	99 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	CKB	P12277	381 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	GZMA	P12544	262 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	P4HA1	P13674	534 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	TNNI1	P19237	187 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	RFC2	P35250	354 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	TNFSF9	P41273	254 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	KIF11	P52732	1056 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	VAV2	P52735	878 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	CUL2	Q13617	745 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	LPIN1	Q14693	890 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	TEAD4	Q15561	434 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	NAB2	Q15742	525 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	ASIC2	Q16515	512 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107		Q6ZS46	218 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FNBP1-208	ENST00000482107	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.73	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms