RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 A0A1W2PS29 197 aa5.85□□□□□ -1.47
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PRPF40A-208ENST00000472760 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 A0A0B4J269 797 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 AREL1O15033 823 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 CCP110O43303 1012 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 PPFIA4O75335 1185 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 C1SP09871 688 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
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