RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 CTBP1Q13363 440 aa8.47□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.47□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.47□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 OR6B3Q8NGW1 331 aa8.47□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 ANKS1AQ92625 1134 aa8.47□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.47□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.47□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 VWC2LB2RUY7 222 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 TMEM233B4DJY2 109 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 MGST3O14880 152 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 IQCB1Q15051 598 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 RNF220Q5VTB9 566 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 LAYNQ6UX15 382 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 MPP5Q8N3R9 675 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.46□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 MYO1CO00159 1063 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 MYO1FO00160 1098 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 KIAA0355O15063 1070 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ZBED1O96006 694 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 SLC13A2Q13183 592 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 KAZNQ674X7 775 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 MAML1Q92585 1016 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 FAM136AQ96C01 138 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 PGBD1Q96JS3 809 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 STK32BQ9NY57 414 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 FOXJ2Q9P0K8 574 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.45□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ADM5C9JUS6 153 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 PPM1DO15297 605 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 TBC1D4O60343 1298 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 THP07101 528 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 BRAFP15056 766 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 BMP5P22003 454 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 MAPK10P53779 464 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 CACNB3P54284 484 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ITIH3Q06033 890 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 TXNRD1Q16881 649 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 SERHLQ9NQF3 203 aa8.44□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 A0A087WWL8 130 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 MPPED1O15442 326 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 MARCH6O60337 910 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 VIPR2P41587 438 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 PTH2RP49190 550 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 LOXL3P58215 753 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 NXPH1P58417 271 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 SP2Q02086 613 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 PTPRRQ15256 657 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ZNF280BQ86YH2 543 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 DPH1Q9BZG8 443 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.43□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 RHCEP18577 417 aa8.42□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 RHDQ02161 417 aa8.42□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 PRR16Q569H4 304 aa8.42□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.42□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 DGKHQ86XP1 1220 aa8.42□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 SLC9A6Q92581 669 aa8.42□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.42□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 MOGAT1Q96PD6 335 aa8.42□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 DKK3Q9UBP4 350 aa8.42□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.42□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 NUDT3O95989 172 aa8.41□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 HRGP04196 525 aa8.41□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ELFN1P0C7U0 828 aa8.41□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 PEX2P28328 305 aa8.41□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 RARRES1P49788 294 aa8.41□□□□□ -1.06
SGCE-210ENST00000472326 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
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