RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471215.1

BUD23-215, Transcript of BUD23, rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor, human

TSL 2

Gene BUD23, Length 3,886 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BUD23-215	ENST00000471215	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215		M0QYV0	167 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	B4GALT5	O43286	388 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	GHR	P10912	638 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	VSTM1	Q6UX27	236 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	TFAP2B	Q92481	460 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	PCYT2	Q99447	389 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215		H7C0C1	242 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	ATG7	O95352	703 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	TGFB3	P10600	412 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	ATP5O	P48047	213 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	ARL4C	P56559	192 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	DNAJC3	Q13217	504 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	SPARCL1	Q14515	664 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	LBX2	Q6XYB7	198 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	MCF2L	O15068	1137 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	BANF1	O75531	89 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	PIAS1	O75925	651 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	ITGB3	P05106	788 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	P4HA1	P13674	534 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	ALDH3A1	P30838	453 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	UBA3	Q8TBC4	463 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	FBF1	Q8TES7	1133 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	COPS5	Q92905	334 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	NDC80	O14777	642 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	MSC	O60682	206 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	DES	P17661	470 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	COPS2	P61201	443 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	OGDH	Q02218	1023 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	NR1H3	Q13133	447 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	KRT81	Q14533	505 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	PDIK1L	Q8N165	341 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	ALLC	Q8N6M5	410 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	TTC13	Q8NBP0	860 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	GOLGA8R	I6L899	631 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	GRAP2	O75791	330 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	CETP	P11597	493 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	MSH2	P43246	934 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	MYO1E	Q12965	1108 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	MORF4L2	Q15014	288 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	PCGF5	Q86SE9	256 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	MPP2	Q14168	576 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	MAGEB18	Q96M61	343 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	MMP19	Q99542	508 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	FZD9	O00144	591 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	ACKR2	O00590	384 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	RASSF9	O75901	435 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	CDH6	P55285	790 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	LRRC38	Q5VT99	294 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	IRF6	O14896	467 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	RBP3	P10745	1247 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	KLRC2	P26717	231 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	SSTR1	P30872	391 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BUD23-215	ENST00000471215	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74

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