RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467529.5

TMEM254-209, Transcript of transmembrane protein 254, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM254, Length 1,963 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM254-209ENST00000467529 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 THPOP40225 353 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 GABRB2P47870 512 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 PDCLQ13371 301 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 LLGL1Q15334 1064 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 PTGISQ16647 500 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 EMBQ6PCB8 327 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 LCLAT1Q6UWP7 414 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 ACOT1Q86TX2 421 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 XYLT1Q86Y38 959 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 CAVIN3Q969G5 261 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 C18orf8Q96DM3 657 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 ZNF560Q96MR9 790 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 PLVAPQ9BX97 442 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 HPCAL4Q9UM19 191 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 PCNTO95613 3336 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 KPNA7A9QM74 516 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 F8VP50 259 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 HCRTO43612 131 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 PFKMP08237 780 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 FAM153BP0C7A2 387 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 KRT3P12035 628 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 TCF4P15884 667 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 CHRNA3P32297 505 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 PTGIRP43119 386 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 SSR1P43307 286 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 GSCP56915 257 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 DR1Q01658 176 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 NNTQ13423 1086 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 STILQ15468 1287 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 CYP1B1Q16678 543 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 FAM153CQ494X1 144 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 TTC27Q6P3X3 843 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 KATNAL2Q8IYT4 538 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 OR6B3Q8NGW1 331 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 JOSD2Q8TAC2 188 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 ZBTB9Q96C00 473 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 ZFP42Q96MM3 310 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 SYNCQ9H7C4 482 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 CHST12Q9NRB3 414 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 ST7Q9NRC1 585 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 WDR35Q9P2L0 1181 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 FAM153AQ9UHL3 310 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 LCMT1Q9UIC8 334 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 TSPAN16Q9UKR8 245 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.5□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 FAM187AA6NFU0 413 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 H3BQF6 201 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 GPR182O15218 404 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 FGFR1P11362 822 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 ECHS1P30084 290 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 LRPAP1P30533 357 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 GJC1P36383 396 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 PNPLA4P41247 253 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 TAF6P49848 677 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 GPS2Q13227 327 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 CUL1Q13616 776 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 ITGA7Q13683 1181 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 SV2CQ496J9 727 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 RNF180Q86T96 592 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 UNC93AQ86WB7 457 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 NIPA2Q8N8Q9 360 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 RAET1EQ8TD07 263 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 SEC14L1Q92503 715 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 MCRS1Q96EZ8 462 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 DPEP3Q9H4B8 488 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 PCYOX1Q9UHG3 505 aa9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 A8MXQ7 604 aa9.48□□□□□ -0.89
TMEM254-209ENST00000467529 DAPK3O43293 454 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms