RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.06□□□□□ -1.12
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USP54-210ENST00000466048 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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USP54-210ENST00000466048 ISCUQ9H1K1 167 aa8.05□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.05□□□□□ -1.12
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