RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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IMP4-209ENST00000462357 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 FAM171BQ6P995 826 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 VSTM1Q6UX27 236 aa21.97■■□□□ 1.11
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IMP4-209ENST00000462357 UNC93AQ86WB7 457 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.97■■□□□ 1.11
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IMP4-209ENST00000462357 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.97■■□□□ 1.11
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IMP4-209ENST00000462357 GDE1Q9NZC3 331 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 SCN1AP35498 2009 aa21.97■■□□□ 1.11
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IMP4-209ENST00000462357 CSH2P0DML3 217 aa21.95■■□□□ 1.1
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IMP4-209ENST00000462357 PI4K2BG5E9Z4 385 aa21.94■■□□□ 1.1
IMP4-209ENST00000462357 TRIM66O15016 1216 aa21.94■■□□□ 1.1
IMP4-209ENST00000462357 MTMR3Q13615 1198 aa21.94■■□□□ 1.1
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IMP4-209ENST00000462357 THAP9Q9H5L6 903 aa21.93■■□□□ 1.1
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IMP4-209ENST00000462357 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.93■■□□□ 1.1
IMP4-209ENST00000462357 PLXNA3P51805 1871 aa21.92■■□□□ 1.1
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IMP4-209ENST00000462357 CDH8P55286 799 aa21.92■■□□□ 1.1
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IMP4-209ENST00000462357 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
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IMP4-209ENST00000462357 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.91■■□□□ 1.1
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