RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 PSMG2Q969U7 264 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 NXPE3Q969Y0 559 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 TMEM221A6NGB7 291 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 ANHXE9PGG2 379 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 M0R296 226 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 HLA-DRAP01903 254 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 PDGFRBP09619 1106 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 FAM163BP0C2L3 166 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 TMC8Q8IU68 726 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 TAF4BQ92750 862 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.18■■□□□ 1.14
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VARS-218ENST00000459667 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 ABCB6Q9NP58 842 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 GDE1Q9NZC3 331 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.18■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 ATP2C2O75185 946 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 MICAL2O94851 1124 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 FAM171BQ6P995 826 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 PARM1Q6UWI2 310 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 MTSS1LQ765P7 747 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 FGF14Q92915 247 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 MOSPD3O75425 235 aa22.16■■□□□ 1.14
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VARS-218ENST00000459667 CYP2F1P24903 491 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 RAP1GAPP47736 663 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 GIPC2Q8TF65 315 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 NELFBQ8WX92 580 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 MYLPFQ96A32 169 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 ASIC4Q96FT7 647 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
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VARS-218ENST00000459667 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 NME7Q9Y5B8 376 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 A8MXQ7 604 aa22.15■■□□□ 1.14
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VARS-218ENST00000459667 GTF2H1P32780 548 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 GPR15P49685 360 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 MXI1P50539 228 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 TEAD2Q15562 447 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 TAF12Q16514 161 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 KRT39Q6A163 491 aa22.15■■□□□ 1.14
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VARS-218ENST00000459667 POTEHQ6S545 545 aa22.15■■□□□ 1.14
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VARS-218ENST00000459667 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 A0A1W2PRU2 124 aa22.14■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 FGF19O95750 216 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 CDH8P55286 799 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 TTI2Q6NXR4 508 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 CEP63Q96MT8 703 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 KXD1Q9BQD3 176 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.14■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 CYP27A1Q02318 531 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 PAK1Q13153 545 aa22.13■■□□□ 1.13
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