RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATP2A3Q93084 1043 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCL26Q9Y258 94 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 N4BP3O15049 544 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DFNA5O60443 496 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VPS4BO75351 444 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNM2P50570 870 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NR1H3Q13133 447 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNAB2Q13303 367 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF1BPQ96EK5 621 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NLRP4Q96MN2 994 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC46A1Q96NT5 459 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VPS4AQ9UN37 437 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDRT15L2A8MXV6 281 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LAD1O00515 517 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNK3O14649 394 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OATP04181 439 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRT7P08729 469 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NCAM1P13591 858 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AKAP5P24588 427 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP4F8P98187 520 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL9RQ01113 521 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCAF12L1Q5VU92 463 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ASB3Q9Y575 518 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A1B0GTQ1 180 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF213O14771 459 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WIPF1O43516 503 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CD6P30203 668 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPHB3P54753 998 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PADI6Q6TGC4 694 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KSR1Q8IVT5 923 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEPDC7Q96QD5 511 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CD93Q9NPY3 652 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLK14Q9P0G3 267 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAD2L2Q9UI95 211 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL6A5A8TX70 2615 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 METTL12A8MUP2 240 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRAPPC3O43617 180 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CKMT2P17540 419 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AXLP30530 894 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BFSP1Q12934 665 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP4Q13107 963 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NAB2Q15742 525 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMTNL2Q2TAL5 461 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EMC10Q5UCC4 262 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLEC14AQ86T13 490 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C12orf40Q86WS4 652 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MCEMP1Q8IX19 187 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LURAP1Q96LR2 239 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACAP3Q96P50 834 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TDP1Q9NUW8 608 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PARP2Q9UGN5 583 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXL5Q9UKA1 691 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A0A0MRY4 1105 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 H7C4K7 107 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACP1P24666 158 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CTSKP43235 329 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRIA4P48058 902 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTF1Q14872 753 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TEAD4Q15561 434 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALX1Q15699 326 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOTUMQ6P988 496 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GATAD2AQ86YP4 633 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms