RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 CEP95Q96GE4 821 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 KAZALD1Q96I82 304 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 NARFQ9UHQ1 456 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 MARCH11A6NNE9 402 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 KIAA0355O15063 1070 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 BPIP17213 487 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
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C9orf3-205ENST00000427193 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 EXOC6Q8TAG9 804 aa6.72□□□□□ -1.33
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C9orf3-205ENST00000427193 CAVIN3Q969G5 261 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 ACAP3Q96P50 834 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 DDX19BQ9UMR2 479 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 A0A087X0B3 334 aa6.71□□□□□ -1.34
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C9orf3-205ENST00000427193 ULK1O75385 1050 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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C9orf3-205ENST00000427193 SEC24CP53992 1094 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 MTX1Q13505 466 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 GCKRQ14397 625 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 MST1LQ2TV78 715 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 METRNLQ641Q3 311 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 CCDC191Q8NCU4 936 aa6.71□□□□□ -1.34
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C9orf3-205ENST00000427193 CLRN1P58418 232 aa6.7□□□□□ -1.34
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C9orf3-205ENST00000427193 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.7□□□□□ -1.34
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C9orf3-205ENST00000427193 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 SCN7AQ01118 1682 aa6.7□□□□□ -1.34
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C9orf3-205ENST00000427193 MASP2O00187 686 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 GRM8O00222 908 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 ZEB2O60315 1214 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 SPDEFO95238 335 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 NTSR2O95665 410 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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C9orf3-205ENST00000427193 ENPP1P22413 925 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 NOGQ13253 232 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 TP53BP2Q13625 1128 aa6.69□□□□□ -1.34
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C9orf3-205ENST00000427193 PRR16Q569H4 304 aa6.69□□□□□ -1.34
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C9orf3-205ENST00000427193 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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C9orf3-205ENST00000427193 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.69□□□□□ -1.34
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C9orf3-205ENST00000427193 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 NEU1Q99519 415 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 MYD88Q99836 296 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 IFT22Q9H7X7 185 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 COX11Q9Y6N1 276 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-205ENST00000427193 CDHR2Q9BYE9 1310 aa6.69□□□□□ -1.34
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