RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, human

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1A-204	ENST00000424089	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	MON1B	Q7L1V2	547 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	LRRC45	Q96CN5	670 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	KCNH6	Q9H252	994 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	PARVA	Q9NVD7	372 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	AKT3	Q9Y243	479 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	DERA	Q9Y315	318 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	C2CD2	Q9Y426	696 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	CEP83	Q9Y592	693 aa		10.65	□□□□□ -0.7
POLR1A-204	ENST00000424089	TET1	Q8NFU7	2136 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	NRCAM	Q92823	1304 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089		A0A1B0GUA9	196 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	THAP12	O43422	761 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	LPXN	O60711	386 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	HSF2BP	O75031	334 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	EFCAB14	O75071	495 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ARHGEF15	O94989	841 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PAEP	P09466	180 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	STAG3L1	P0CL83	205 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	MYBL2	P10244	700 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	MYL6	P60660	151 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	NOMO3	P69849	1222 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	IGBP1	P78318	339 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	AMHR2	Q16671	573 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	CYP1B1	Q16678	543 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	NAA35	Q5VZE5	725 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ALG3	Q92685	438 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	EXOC4	Q96A65	974 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	FAM212A	Q96EL1	285 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	LHX5	Q9H2C1	402 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ACP6	Q9NPH0	428 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	CISH	Q9NSE2	258 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089		A0A087WZ62	844 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089		A6NNZ2	444 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PSTPIP1	O43586	416 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PHF2	O75151	1096 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PROSC	O94903	275 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ERLIN2	O94905	339 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	KCNA5	P22460	613 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	MMP8	P22894	467 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	AXL	P30530	894 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	CETN2	P41208	172 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	FNTA	P49354	379 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	DR1	Q01658	176 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	MTMR3	Q13615	1198 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	SEZ6	Q53EL9	994 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	NLRP7	Q8WX94	980 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		10.63	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms