RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RABEP1Q15276 862 aa14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST3GAL2Q16842 350 aa14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOXL4Q96JB6 756 aa14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EBF3Q9H4W6 596 aa14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.2□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KPNA7A9QM74 516 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AXIN1O15169 862 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATG13O75143 517 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMP15O95972 392 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIMK1P53667 647 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPY1Q01534 308 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL31Q6EBC2 164 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIN3Q8TB24 985 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMX3Q96JJ7 454 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TDP1Q9NUW8 608 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.19□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOBPA7XYQ1 873 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF40O75150 1001 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKAP3O75969 853 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL18RAPO95256 599 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EGFP01133 1207 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF806P0C7X5 589 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSH1P0DML2 217 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSH2P0DML3 217 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC192P0DO97 292 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNPLA4P41247 253 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAP1GAPP47736 663 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR15P49685 360 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMPD2Q01433 879 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC6Q16204 474 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C8orf34Q49A92 452 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TXNDC8Q6A555 127 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KBTBD6Q86V97 674 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STKLD1Q8NE28 680 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HVCN1Q96D96 273 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TADA3O75528 432 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARSAP15289 507 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DRD1P21728 446 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADSSP30520 456 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDGFRLQ15198 375 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MON1AQ86VX9 555 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFR1Q86XK3 245 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.18□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R37O75864 691 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDIT3P35638 169 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNT7BP56706 349 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTF1Q14872 753 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POSTNQ15063 836 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOC4Q96A65 974 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HHIPQ96QV1 700 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 L1RE1Q9UN81 338 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.17□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP24Q9UPU5 2620 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOL4O94818 638 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGB3P05106 788 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR29P0C7W0 189 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GJA4P35212 333 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPLP40238 635 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms