RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CFAP221Q4G0U5 840 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF394Q53GI3 561 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 XKR4Q5GH76 650 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 FAM26DQ5JW98 314 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 NAA35Q5VZE5 725 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CREG2Q8IUH2 290 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM35BQ8NCS4 154 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 MSANTD4Q8NCY6 345 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CXorf38Q8TB03 319 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 RABGGTAQ92696 567 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 PGBD4Q96DM1 585 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF560Q96MR9 790 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CDK15Q96Q40 435 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 NUP85Q9BW27 656 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SMYD3Q9H7B4 428 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ADAM22Q9P0K1 906 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 HES2Q9Y543 173 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SQORQ9Y6N5 450 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SCINQ9Y6U3 715 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1W2PQY0 241 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF185O15231 689 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SPOPO43791 374 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CILPO75339 1184 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CALCAP01258 141 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CALB1P05937 261 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 GHRP10912 638 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 VDRP11473 427 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CD52P31358 61 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CXCR5P32302 372 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 RAP1GAPP47736 663 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 DNA2P51530 1060 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CDH8P55286 799 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 NOMO3P69849 1222 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ITIH3Q06033 890 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 STILQ15468 1287 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SV2CQ496J9 727 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SGO2Q562F6 1265 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 NT5DC3Q86UY8 548 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ERICH1Q86X53 443 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 PASD1Q8IV76 773 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 UBL4BQ8N7F7 174 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 COG1Q8WTW3 980 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ANKRD7Q92527 254 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 WNT8BQ93098 351 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ITPKCQ96DU7 683 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 PSMB7Q99436 277 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 WNT8AQ9H1J5 351 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 LHX5Q9H2C1 402 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ERVK-5Q9HDB9 667 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ABCB6Q9NP58 842 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 PARVAQ9NVD7 372 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 KLK14Q9P0G3 267 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 PADI3Q9ULW8 664 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 PHF24Q9UPV7 400 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms