RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411348.1

RNU6-57P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 57, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-57P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-57P-201ENST00000411348 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 UCP3P55916 312 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 MC2RQ01718 297 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 PTPRRQ15256 657 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 LLGL1Q15334 1064 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 MGAT5BQ3V5L5 792 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 KIAA0895LQ68EN5 471 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 IGFL4Q6B9Z1 124 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 VWA1Q6PCB0 445 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 Q6ZNX1 250 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 MRGPRGQ86SM5 289 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 LDLRAD3Q86YD5 345 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 PJA1Q8NG27 643 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 TIFAQ96CG3 184 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 LRIG1Q96JA1 1093 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC46A1Q96NT5 459 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 NT5C1BQ96P26 610 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 MESP1Q9BRJ9 268 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 PTDSS2Q9BVG9 487 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 ALG8Q9BVK2 526 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 BHMT2Q9H2M3 363 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 SMURF2Q9HAU4 748 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF287Q9HBT7 754 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 CASS4Q9NQ75 786 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 SERHLQ9NQF3 203 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZSCAN32Q9NX65 697 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 PACSIN3Q9UKS6 424 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 F5H697 171 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 DCLK1O15075 740 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 YY2O15391 372 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 MPPED1O15442 326 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 PEX1O43933 1283 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 TLR5O60602 858 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 RAMP2O60895 175 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 VPS4BO75351 444 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 NXPH3O95157 252 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 GCP02774 474 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 FOLR3P41439 243 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 SEC24CP53992 1094 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 TGFB2P61812 414 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 FMO1Q01740 532 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 CTBP1Q13363 440 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 FHL2Q14192 279 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 E2F2Q14209 437 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 INSCQ1MX18 579 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 HECTD2Q5U5R9 776 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 ICE2Q659A1 982 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 LAIR1Q6GTX8 287 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMEM108Q6UXF1 575 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC30A10Q6XR72 485 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 Q6ZPA2 131 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF627Q7L945 461 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 MICU3Q86XE3 530 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC15A4Q8N697 577 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC16A11Q8NCK7 471 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 ATRIPQ8WXE1 791 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 MAML1Q92585 1016 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 PHKBQ93100 1093 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 CAVIN3Q969G5 261 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 SPSB4Q96A44 273 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM136AQ96C01 138 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 PBKQ96KB5 322 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 Q96MF0 132 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 PPP1R9BQ96SB3 815 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 AIFM2Q9BRQ8 373 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF700Q9H0M5 742 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARNT2Q9HBZ2 717 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 PNPLA8Q9NP80 782 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 STK32BQ9NY57 414 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 PADI4Q9UM07 663 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 SH2B3Q9UQQ2 575 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 COL4A3Q01955 1670 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 USP19O94966 1318 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-57P-201ENST00000411348 WDR27A2RRH5 827 aa2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms