RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410983.1

RNU6-564P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 564, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-564P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-564P-201ENST00000410983 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 TRIM38O00635 465 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 DCLK1O15075 740 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 TRIM13O60858 407 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 ARL4CP56559 192 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 KRT17Q04695 432 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 LAYNQ6UX15 382 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 SYT12Q8IV01 421 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 FUKQ8N0W3 1084 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 RAD54BQ9Y620 910 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF536O15090 1300 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 AQP7P3A6NL99 342 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 RAD17O75943 681 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 ITGA5P08648 1049 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 EGR1P18146 543 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 CHRM3P20309 590 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 LRPAP1P30533 357 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 NPY5RQ15761 445 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 METRNLQ641Q3 311 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 FCRL6Q6DN72 434 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 RFX8Q6ZV50 586 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 POC1BQ8TC44 478 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 DKK4Q9UBT3 224 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF69Q9UC07 566 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-564P-201ENST00000410983 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 IRAK2O43187 625 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 TNFRSF6BO95407 300 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 LOXL3P58215 753 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 LILRA4P59901 499 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 NHLH2Q02577 135 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 HHEXQ03014 270 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 TAF5Q15542 800 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 SYT8Q8NBV8 401 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 EID2BQ96D98 161 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 TBATAQ96M53 351 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 RRN3Q9NYV6 651 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 LEFTY2O00292 366 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 COQ9O75208 318 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 SOAT2O75908 522 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 SPATA31D3P0C874 917 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 ATICP31939 592 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 CNR2P34972 360 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 TEX19Q8NA77 164 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 MED15Q96RN5 788 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 NEU1Q99519 415 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 MNTQ99583 582 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-564P-201ENST00000410983 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms