RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 CBWD6Q4V339 395 aa22.22■■□□□ 1.15
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C4orf48-201ENST00000409248 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.22■■□□□ 1.15
C4orf48-201ENST00000409248 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.22■■□□□ 1.15
C4orf48-201ENST00000409248 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.22■■□□□ 1.15
C4orf48-201ENST00000409248 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
C4orf48-201ENST00000409248 TAF4BQ92750 862 aa22.22■■□□□ 1.15
C4orf48-201ENST00000409248 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.22■■□□□ 1.15
C4orf48-201ENST00000409248 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.22■■□□□ 1.15
C4orf48-201ENST00000409248 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.21■■□□□ 1.15
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C4orf48-201ENST00000409248 IQCEQ6IPM2 695 aa22.2■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.2■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.2■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 PTPN2P17706 415 aa22.19■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 LEMD2Q8NC56 503 aa22.19■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 SYT15Q9BQS2 421 aa22.19■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 VPS16Q9H269 839 aa22.19■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 RAB20Q9NX57 234 aa22.19■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 NTHL1P78549 312 aa22.18■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.18■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 WDR44Q5JSH3 913 aa22.18■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.18■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.18■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.18■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 ABCB6Q9NP58 842 aa22.18■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 GBP6Q6ZN66 633 aa22.17■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.17■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.17■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 ASB3Q9Y575 518 aa22.17■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.16■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 LGALS16A8MUM7 142 aa22.16■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF197O14709 1029 aa22.16■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.16■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.16■■□□□ 1.14
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