RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 FERP16591 822 aa30.01■■■□□ 2.4
GIPC1-202ENST00000393028 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
GIPC1-202ENST00000393028 GNA15P30679 374 aa30.01■■■□□ 2.4
GIPC1-202ENST00000393028 LRRTM3Q86VH5 581 aa30.01■■■□□ 2.4
GIPC1-202ENST00000393028 OR8K1Q8NGG5 319 aa30.01■■■□□ 2.4
GIPC1-202ENST00000393028 TFAP2BQ92481 460 aa30.01■■■□□ 2.4
GIPC1-202ENST00000393028 TNIP3Q96KP6 325 aa30.01■■■□□ 2.4
GIPC1-202ENST00000393028 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa30.01■■■□□ 2.4
GIPC1-202ENST00000393028 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF576Q9H609 170 aa30.01■■■□□ 2.4
GIPC1-202ENST00000393028 TMLHEQ9NVH6 421 aa30.01■■■□□ 2.4
GIPC1-202ENST00000393028 AIPL1Q9NZN9 384 aa30.01■■■□□ 2.4
GIPC1-202ENST00000393028 BACE2Q9Y5Z0 518 aa30.01■■■□□ 2.4
GIPC1-202ENST00000393028 OR6C75A6NL08 312 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 FSCN2O14926 492 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 LILRB3O75022 631 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 CXCL14O95715 111 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC130P13994 396 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 CRYBG2Q8N1P7 616 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 PKMYT1Q99640 499 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 CLSTN3Q9BQT9 956 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 ZSWIM1Q9BR11 485 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 GTF3C4Q9UKN8 822 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 HIDE1A8MVS5 230 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 SKILP12757 684 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 CPB1P15086 417 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 PTK2Q05397 1052 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 SLC39A12Q504Y0 691 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 EPS8L1Q8TE68 723 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 SLC20A1Q8WUM9 679 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 THAP12O43422 761 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 CYP11B1P15538 503 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 OR1D2P34982 312 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 PDE6CP51160 858 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 TAF3Q5VWG9 929 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC186Q7Z3E2 898 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 MYLPFQ96A32 169 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 LRCH3Q96II8 777 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 ROR1Q01973 937 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 SGO2Q562F6 1265 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 SLC8B1Q6J4K2 584 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 WDR59Q6PJI9 974 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 C2orf71A6NGG8 1288 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 CLDN5O00501 218 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 TEX28O15482 410 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 CNPP09543 421 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 VDRP11473 427 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 BPIFB4P59827 614 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 KLHL30Q0D2K2 578 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 HGSNATQ68CP4 663 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 FAM171BQ6P995 826 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 PCED1BQ96HM7 432 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 PGLYRP2Q96PD5 576 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 DNAI2Q9GZS0 605 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 RXFP1Q9HBX9 757 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 WDR27A2RRH5 827 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 LPXNO60711 386 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 CFHP08603 1231 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 ADORA2BP29275 332 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 CYP27A1Q02318 531 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 FMNL3Q8IVF7 1028 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 GPR65Q8IYL9 337 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 SLC2A14Q8TDB8 520 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 B3GNT5Q9BYG0 378 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 FNIP2Q9P278 1114 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 O00370 1275 aa29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 PRKCIP41743 596 aa29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 NDUFV1P49821 464 aa29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 GSDMDP57764 484 aa29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 CREMQ03060 361 aa29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 SMYD5Q6GMV2 418 aa29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF606Q8WXB4 792 aa29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 CYFIP2Q96F07 1278 aa29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 MED10Q9BTT4 135 aa29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-202ENST00000393028 HAUS4Q9H6D7 363 aa29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms