RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 K7ENM7 598 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ECE2O60344 883 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 DNTTP04053 509 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NQO1P15559 274 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC25BP30305 580 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SSTP61278 116 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC20Q12834 499 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM32Q13049 653 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CUL2Q13617 745 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 26.9
RABGEF1-202ENST00000380828 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MANEAQ5SRI9 462 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC6Q86TZ1 520 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA24Q86W54 205 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC13Q8NBP0 860 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GAL3ST1Q99999 423 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 VCXQ9H320 206 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GORASP2Q9H8Y8 452 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 AGPSO00116 658 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ADCY3O60266 1144 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FZD6O60353 706 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT7P08729 469 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 G0S2P27469 103 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MAPKAPK2P49137 400 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CCNG1P51959 295 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CACNA2D1P54289 1103 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 VEPH1Q14D04 833 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CDKL4Q5MAI5 379 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PEX26Q7Z412 305 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NME9Q86XW9 330 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CDH26Q8IXH8 852 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SELENOSQ9BQE4 189 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC42Q9Y546 428 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ADCY9O60503 1353 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CHD4Q14839 1912 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA0232Q92628 1395 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0G2JPF8 293 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 OR6C74A6NCV1 312 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GABBR2O75899 941 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 F13A1P00488 732 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 EPB41P11171 864 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC5A1P13866 664 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PLIN5Q00G26 463 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SQLEQ14534 574 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NKAIN4Q8IVV8 208 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 VSTM4Q8IW00 320 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NRSN1Q8IZ57 195 aa7.15□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 CTRCQ99895 268 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 BRD9Q9H8M2 597 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GID8Q9NWU2 228 aa7.15□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D14Q9P2M4 693 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB21Q9UL25 225 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM50BQ9Y247 325 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FUOMA2VDF0 154 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA8OA6NCC3 632 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA8NF8WBI6 632 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SYN3O14994 580 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFA2O43678 99 aa7.15□□□□□ -1.26
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