RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373337.3

TMEM35B-201, Transcript of transmembrane protein 35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM35B, Length 922 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35B-201ENST00000373337 BCO2Q9BYV7 579 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 ABCB6Q9NP58 842 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 OBP2AQ9NY56 170 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 KLRC4O43908 158 aa21.44■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.44■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 SOWAHAQ2M3V2 549 aa21.44■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 TMEM150AQ86TG1 271 aa21.44■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 ATXN3LQ9H3M9 355 aa21.44■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.44■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 HELZP42694 1942 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 CHADO15335 359 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 KRT19P08727 400 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 SLFN14P0C7P3 912 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 SP9P0CG40 484 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 CDC25CP30307 473 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 MYL7Q01449 175 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 PSMD6Q15008 389 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 LRRC3BQ96PB8 259 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 TASP1Q9H6P5 420 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 HPSEQ9Y251 543 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 DCHS1Q96JQ0 3298 aa21.43■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 MAN2B1O00754 1011 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 ZNF263O14978 683 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 TNNC2P02585 160 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 LHX1P48742 406 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 CDR1P51861 262 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 CYP24A1Q07973 514 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 MYO1EQ12965 1108 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 GPR158Q5T848 1215 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 FAM171BQ6P995 826 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 XXYLT1Q8NBI6 393 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 HPDLQ96IR7 371 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 SEMA4AQ9H3S1 761 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.42■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 SOBPA7XYQ1 873 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 HCRTO43612 131 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 PRAMEF12O95522 483 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 F11P03951 625 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 AFMP43652 599 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 CYP4F8P98187 520 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 CCDC142Q17RM4 750 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 HS2ST1Q7LGA3 356 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 NELFCDQ8IXH7 590 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 GIPC2Q8TF65 315 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 MSANTD3Q96H12 275 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 CGRRF1Q99675 332 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 SLC39A2Q9NP94 309 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 PIAS3Q9Y6X2 628 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 CLIC2O15247 247 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 NCAM2O15394 837 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 NOL4O94818 638 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 PFKFB1P16118 471 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 CMA1P23946 247 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 PCSK1P29120 753 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 GPR15P49685 360 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 NLRP12P59046 1061 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 NELL1Q92832 810 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 PAGE5Q96GU1 130 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 MYRFLQ96LU7 910 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 SLC46A2Q9BY10 475 aa21.4■■□□□ 1.02
TMEM35B-201ENST00000373337 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms