RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362803.1

SNORD16-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 16, humanhuman

BASIC

Gene SNORD16, Length 99 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD16-201ENST00000362803 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 CCDC42Q96M95 316 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 MED10Q9BTT4 135 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 GPR88Q9GZN0 384 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 MIS12Q9H081 205 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ANK1P16157 1881 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 C2CD2LO14523 706 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 TRIM66O15016 1216 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 AKR1B10O60218 316 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 FAM200BP0CF97 657 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 SETSIPP0DME0 302 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 LMO2P25791 158 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 KLRC2P26717 231 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 CLCN1P35523 988 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 BCAT1P54687 386 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ARPP19P56211 112 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 CDR2Q01850 454 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 CYP27A1Q02318 531 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 PLD1Q13393 1074 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 RAB33AQ14088 237 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 PTPN14Q15678 1187 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ZNF697Q5TEC3 545 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 FAM171BQ6P995 826 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 VSTM1Q6UX27 236 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 RTL10Q7L3V2 364 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 OSTM1Q86WC4 334 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 WHAMMQ8TF30 809 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 TWNKQ96RR1 684 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 AGPAT1Q99943 283 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 LHX5Q9H2C1 402 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ZNF576Q9H609 170 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ABCB6Q9NP58 842 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 EHD2Q9NZN4 543 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.8□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.79□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 M0QYV0 167 aa6.79□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 O00370 1275 aa6.79□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 FSCN2O14926 492 aa6.79□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 GRM6O15303 877 aa6.79□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ARHGAP6O43182 974 aa6.79□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 TBC1D4O60343 1298 aa6.79□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 LILRB3O75022 631 aa6.79□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 GLUD1P00367 558 aa6.79□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 ATF2P15336 505 aa6.79□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 NPR3P17342 541 aa6.79□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SNORD16-201ENST00000362803 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms