RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 SEC23AQ15436 765 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 LONP2Q86WA8 852 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 MTBPQ96DY7 904 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 GPR63Q9BZJ6 419 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 GRB10Q13322 594 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 GGT7Q9UJ14 662 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 MED24O75448 989 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 HMOX2P30519 316 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 ANLNQ9NQW6 1124 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 TMC2Q8TDI7 906 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 SHMT1P34896 483 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 LHX1P48742 406 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 LRRC14Q15048 493 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 TMEM154Q6P9G4 183 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 FBXO32Q969P5 355 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 VWA5AO00534 786 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 CYB561D2O14569 222 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 CST8O60676 142 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 HAUS5O94927 633 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ARFIP2P53365 341 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 DDIASQ8IXT1 998 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 TEKT4Q8WW24 435 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 NRBF2Q96F24 287 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ZIM3Q96PE6 472 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 COG4Q9H9E3 785 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 FBXW4P57775 412 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 MYBPC2Q14324 1141 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 KCNB2Q92953 911 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF263O14978 683 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 AMPD2Q01433 879 aa21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 H0Y626 953 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 RABGAP1LQ5R372 815 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 GRAMD4Q6IC98 578 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 WDCPQ9H6R7 721 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.027e-9■■■■□ 25.3
NCKAP1-201ENST00000360982 ANXA9O76027 345 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ALDH2P05091 517 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ETFBP38117 255 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.022e-6■■■□□ 16.1
NCKAP1-201ENST00000360982 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 RBBP7Q16576 425 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 TMC7Q7Z402 723 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 CGRRF1Q99675 332 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 CDH16O75309 829 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ATICP31939 592 aa21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 CCDC22O60826 627 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 FBXO21O94952 628 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 VTNP04004 478 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 SPRP35270 261 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ADCK2Q7Z695 626 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 AKT1S1Q96B36 256 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 GRAMD1AQ96CP6 724 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 PKP3Q9Y446 797 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ALG6Q9Y672 507 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 CCT8L1PA6NM43 557 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 COMTP21964 271 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 BCAT1P54687 386 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 WDR93Q6P2C0 686 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 F5H5T6 163 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 INSRRP14616 1297 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 RRM2BQ7LG56 351 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 LINC00523Q86TU6 105 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 LCA5Q86VQ0 697 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 M0QYT0 321 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms