RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 TRIML1Q8N9V2 468 aa28.87■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 OR6B3Q8NGW1 331 aa28.87■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 GPR152Q8TDT2 470 aa28.87■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 GBP4Q96PP9 640 aa28.87■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 HSFX1Q9UBD0 423 aa28.87■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 DOCK6Q96HP0 2047 aa28.87■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 ASS1P00966 412 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 PPP1R2P41236 205 aa28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 EPHA5P54756 1037 aa28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 PLD1Q13393 1074 aa28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 SDHAF4Q5VUM1 108 aa28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 FAM171BQ6P995 826 aa28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 GPT2Q8TD30 523 aa28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 GIPC2Q8TF65 315 aa28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 EDAQ92838 391 aa28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 SEMA4DQ92854 862 aa28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 MYLPFQ96A32 169 aa28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM8AQ9HCN3 771 aa28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 CDH9Q9ULB4 789 aa28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 SORCS3Q9UPU3 1222 aa28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 NOTCH4Q99466 2003 aa28.86■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 CYP2F1P24903 491 aa28.85■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 ASPAP45381 313 aa28.85■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 EPHB3P54753 998 aa28.85■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 SMARCB1Q12824 385 aa28.85■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 PAK1Q13153 545 aa28.85■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa28.85■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 MCRS1Q96EZ8 462 aa28.85■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 SNX25Q9H3E2 840 aa28.85■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 ASAH2Q9NR71 780 aa28.85■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 TUFMP49411 452 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 HTR4Q13639 388 aa28.84■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 CBWD6Q4V339 395 aa28.84■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 CBWD3Q5JTY5 395 aa28.84■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 CBWD5Q5RIA9 395 aa28.84■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 PARM1Q6UWI2 310 aa28.84■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 FGF14Q92915 247 aa28.84■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 PSMG2Q969U7 264 aa28.84■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 MED15Q96RN5 788 aa28.84■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 NUP62CLQ9H1M0 184 aa28.84■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 HMGXB4Q9UGU5 601 aa28.84■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 NUMBLQ9Y6R0 609 aa28.84■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 ANHXE9PGG2 379 aa28.83■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 MXI1P50539 228 aa28.83■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 DDR2Q16832 855 aa28.83■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 MDH1BQ5I0G3 518 aa28.83■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 CYP4A22Q5TCH4 519 aa28.83■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 TCERG1LQ5VWI1 586 aa28.83■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 KRT39Q6A163 491 aa28.83■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 SHKBP1Q8TBC3 707 aa28.83■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 FAM200AQ8TCP9 573 aa28.83■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa28.83■■■□□ 2.21
TPGS1-201ENST00000359315 A8MXQ7 604 aa28.82■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 NARSO43776 548 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 FAM163BP0C2L3 166 aa28.82■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 GTF2H1P32780 548 aa28.82■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 NOP14P78316 857 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 ORC1Q13415 861 aa28.82■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 MTMR3Q13615 1198 aa28.82■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 TAF4BQ92750 862 aa28.82■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 SLC35C1Q96A29 364 aa28.82■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 PCED1BQ96HM7 432 aa28.82■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 CEP63Q96MT8 703 aa28.82■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 ABCB6Q9NP58 842 aa28.82■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1W2PRU2 124 aa28.81■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 BICDL2A1A5D9 508 aa28.81■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 TEAD2Q15562 447 aa28.81■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 CFAP221Q4G0U5 840 aa28.81■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM67Q6ZTA4 783 aa28.81■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 GAREM2Q75VX8 874 aa28.81■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa28.81■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 ZSWIM3Q96MP5 696 aa28.81■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 IGSF9Q9P2J2 1179 aa28.81■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 DOCK8Q8NF50 2099 aa28.81■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 CYP27A1Q02318 531 aa28.8■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 TDGQ13569 410 aa28.8■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM31Q5JXX7 168 aa28.8■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 STXBP5Q5T5C0 1151 aa28.8■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 FOXR2Q6PJQ5 311 aa28.8■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 SLC44A3Q8N4M1 653 aa28.8■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa28.8■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 ASIC4Q96FT7 647 aa28.8■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 LRFN3Q9BTN0 628 aa28.8■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 BCO2Q9BYV7 579 aa28.8■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 IL21Q9HBE4 155 aa28.8■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 ASB3Q9Y575 518 aa28.8■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF197O14709 1029 aa28.79■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 GPR37L1O60883 481 aa28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms