RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 GRIK4Q16099 956 aa16.11■□□□□ 0.17
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PTPRO-202ENST00000348962 SMYD3Q9H7B4 428 aa16.11■□□□□ 0.17
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PTPRO-202ENST00000348962 TMC2Q8TDI7 906 aa16.11■□□□□ 0.17
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PTPRO-202ENST00000348962 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
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PTPRO-202ENST00000348962 ERVK-9P63128 1117 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRO-202ENST00000348962 ERVK-24P63145 666 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRO-202ENST00000348962 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRO-202ENST00000348962 UGT3A1Q6NUS8 523 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRO-202ENST00000348962 SNX31Q8N9S9 440 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRO-202ENST00000348962 DNAJB3Q8WWF6 145 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRO-202ENST00000348962 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
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