RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
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GIPC1-201ENST00000345425 ABHD10Q9NUJ1 306 aa29.55■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 CHD7Q9P2D1 2997 aa29.55■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 VDRP11473 427 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 CPB1P15086 417 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 CD19P15391 556 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 PDE6CP51160 858 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 PTPROQ16827 1216 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM209Q96SK2 561 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 CLSTN3Q9BQT9 956 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 CRTAC1Q9NQ79 661 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 ATP2C2O75185 946 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 CSPG5O95196 566 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 RPL17P18621 184 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 OR1D2P34982 312 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 NDUFV1P49821 464 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 SMARCB1Q12824 385 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 SGO2Q562F6 1265 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 FAM171BQ6P995 826 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
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GIPC1-201ENST00000345425 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 GTF3C4Q9UKN8 822 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 C2orf71A6NGG8 1288 aa29.53■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 MDH1BQ5I0G3 518 aa29.53■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 SLC47A2Q86VL8 602 aa29.53■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 TC2NQ8N9U0 490 aa29.53■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 PKMYT1Q99640 499 aa29.53■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 MYBPHLA2RUH7 354 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 OR4Q2P0C623 313 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 CYP11B1P15538 503 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 ARPP19P56211 112 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 GSDMDP57764 484 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 GPR17Q13304 367 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 STILQ15468 1287 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 SLC39A12Q504Y0 691 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 C12orf29Q8N999 325 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 TEX28O15482 410 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 MED7O43513 233 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 ADH1AP07327 375 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 CNPP09543 421 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 IRS1P35568 1242 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA8FQ08AF8 430 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF697Q5TEC3 545 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 C4orf50Q6ZRC1 276 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 LRRTM3Q86VH5 581 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 ACP6Q9NPH0 428 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 FAM49BQ9NUQ9 324 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 HIDE1A8MVS5 230 aa29.51■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 THAP12O43422 761 aa29.51■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 ROR1Q01973 937 aa29.51■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
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GIPC1-201ENST00000345425 ZNF677Q86XU0 584 aa29.5■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 GPIHBP1Q8IV16 184 aa29.5■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
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GIPC1-201ENST00000345425 PCED1BQ96HM7 432 aa29.5■■■□□ 2.31
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GIPC1-201ENST00000345425 LPIN3Q9BQK8 851 aa29.49■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 TMLHEQ9NVH6 421 aa29.49■■■□□ 2.31
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GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF461Q8TAF7 563 aa29.49■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP29.49■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 MED10Q9BTT4 135 aa29.49■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa29.49■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 CALCAP01258 141 aa29.48■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC130P13994 396 aa29.48■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 KLRC2P26717 231 aa29.48■■■□□ 2.31
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