RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 K7ESF4 209 aa22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 YEATS4O95619 227 aa22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 RETP07949 1114 aa22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 TNK2Q07912 1038 aa22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 PON2Q15165 354 aa22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 E2F4Q16254 413 aa22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 SV2CQ496J9 727 aa22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 HSCBQ8IWL3 235 aa22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 HRO43593 1189 aa22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 EXTL3O43909 919 aa22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 CNR2P34972 360 aa22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 PNPLA4P41247 253 aa22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 CCINQ13939 588 aa22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 LONP2Q86WA8 852 aa22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF560Q96MR9 790 aa22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 RTKNQ9BST9 563 aa22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 CUEDC2Q9H467 287 aa22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.71■■□□□ 1.23
SOCS1-201ENST00000332029 CUTAO60888 179 aa22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 AMPD3Q01432 767 aa22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 DHX58Q96C10 678 aa22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 TRIM9Q9C026 710 aa22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 LRP3O75074 770 aa22.69■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 ITGB3P05106 788 aa22.69■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 SHC4Q6S5L8 630 aa22.69■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.69■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 IQUBQ8NA54 791 aa22.69■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 HPS3Q969F9 1004 aa22.69■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.69■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 DCDC2BA2VCK2 349 aa22.68■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 AVPR1AP37288 418 aa22.68■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 TSPY1Q01534 308 aa22.68■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.68■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 GPD1LQ8N335 351 aa22.68■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.68■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.68■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.68■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 GKN1Q9NS71 199 aa22.68■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.68■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 SPTBN2O15020 2390 aa22.67■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 F11P03951 625 aa22.67■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.223e-8■■□□□ 13.2
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SOCS1-201ENST00000332029 NLRP12P59046 1061 aa22.67■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 ASIC1P78348 528 aa22.67■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.67■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 NETO1Q8TDF5 533 aa22.67■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 FAM84AQ96KN4 292 aa22.67■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.67■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.67■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.67■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.67■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 CCL26Q9Y258 94 aa22.67■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 TCHHQ07283 1943 aa22.67■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 F13A1P00488 732 aa22.66■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 HOXC13P31276 330 aa22.66■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 GPR15P49685 360 aa22.66■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 BFSP1Q12934 665 aa22.66■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.66■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 CEP68Q76N32 757 aa22.66■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.66■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.66■■□□□ 1.22
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