RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 KLRC2P26717 231 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 RARRES1P49788 294 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 MED21Q13503 144 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 TRPC3Q13507 836 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 HELQQ8TDG4 1101 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 FIZ1Q96SL8 496 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 PAFAH2Q99487 392 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 EURLQ9NYK6 297 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 MID2Q9UJV3 735 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-202ENST00000320122 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 DENND3A2RUS2 1198 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 SLC16A4O15374 487 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 ACAP1Q15027 740 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 LRRC39Q96DD0 335 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 SERPINI1Q99574 410 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 TMCO1Q9UM00 188 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 RIMBP2O15034 1052 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 TYROBPO43914 113 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 DGAT1O75907 488 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 RNF8O76064 485 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 TOMM70O94826 608 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 NPR1P16066 1061 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 HSPA13P48723 471 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 HIC1Q14526 733 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 BBS9Q3SYG4 887 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 FSCBQ5H9T9 825 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 ANO5Q75V66 913 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 SV2AQ7L0J3 742 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 BTBD6Q96KE9 485 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 C7orf26Q96N11 449 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 RILPQ96NA2 401 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 ASB3Q9Y575 518 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 B2RBV5 119 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 BIRC5O15392 142 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 CBX6O95503 412 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 RPS6KA3P51812 740 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 TMPRSS15P98073 1019 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 ADCY1Q08828 1119 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 PTK7Q13308 1070 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 LAMB3Q13751 1172 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 MPP2Q14168 576 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 PSMD6Q15008 389 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 KAZNQ674X7 775 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 SPATA24Q86W54 205 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 OPTNQ96CV9 577 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 FBXL18Q96ME1 805 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 WDR18Q9BV38 432 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 HACD3Q9P035 362 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 FCHO1O14526 889 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 OPHN1O60890 802 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 CREB1P16220 341 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 PSMC4P43686 418 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 RAB27AP51159 221 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
LMO3-202ENST00000320122 CUL2Q13617 745 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms