RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311177.6

HOXB9-201, Transcript of homeobox B9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB9, Length 2,581 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9-201ENST00000311177 KATNBL1Q9H079 304 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 VTA1Q9NP79 307 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 POLIQ9UNA4 740 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 SNX24Q9Y343 169 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PLXNB2O15031 1838 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 RAP1GAPP47736 663 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PMS2P54278 862 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 MAMLD1Q13495 774 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PPTC7Q8NI37 304 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 TRIM11Q96F44 468 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PGM2Q96G03 612 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 RAB17Q9H0T7 212 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 NFICP08651 508 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PTGIRP43119 386 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 MSH2P43246 934 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 SLC29A2Q14542 456 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 LRRC14Q15048 493 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 DUPD1Q68J44 220 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 GPR142Q7Z601 462 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 USTQ9Y2C2 406 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 MGAMO43451 1857 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 GJC1P36383 396 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PLTPP55058 493 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 COPS2P61201 443 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PTP4A2Q12974 167 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 CCDC38Q502W7 563 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 LIN9Q5TKA1 542 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 TNNC2P02585 160 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 NUDT17P0C025 328 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 CHRNA3P32297 505 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 ASPAP45381 313 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PHKA2P46019 1235 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 ORC1Q13415 861 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 TAF11Q15544 211 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 CLUL1Q15846 466 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PPP2R5EQ16537 467 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 TFAP2BQ92481 460 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PTPN18Q99952 460 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 SCN4AP35499 1836 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 H3BRB1 525 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 HSPA6P17066 643 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 SMPD1P17405 629 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 SURF1Q15526 300 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 AMHR2Q16671 573 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 MGARPQ8TDB4 240 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 ZFATQ9P243 1243 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 B4GALT4O60513 344 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 STAG3L1P0CL83 205 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 CDH8P55286 799 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 ATP11AP98196 1134 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 SIX4Q9UIU6 781 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 LACTBL1A8MY62 500 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 ADCY6O43306 1168 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 PROSCO94903 275 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 TAS2R40P59535 323 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 GALNTL6Q49A17 601 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 DYDC1Q8WWB3 177 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 NLRP7Q8WX94 980 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 MAML3Q96JK9 1138 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXB9-201ENST00000311177 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms