RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNNI1P19237 187 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 FOLH1Q04609 750 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 CTC1Q2NKJ3 1217 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNT1Q5JUK3 1230 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARPINQ7Z6K5 226 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 DHDDSQ86SQ9 333 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP11CQ8NB49 1132 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 XXYLT1Q8NBI6 393 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 KREMEN1Q96MU8 473 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 DTNAQ9Y4J8 743 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRIM49D1C9J1S8 452 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 E5RJQ4 531 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.065e-6■□□□□ 8.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM182BQ5T319 152 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLFN13Q68D06 897 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLC3Q6P597 504 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 DGKIO75912 1065 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 PSMD7P51665 324 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 SIK1P57059 783 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCNG2Q16589 344 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM102BQ5T8I3 360 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 BSPRYQ5W0U4 402 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 ACAD10Q6JQN1 1059 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 MFSD7Q6UXD7 560 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 POLNQ7Z5Q5 900 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRGUKQ96M69 825 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 HSPBP1Q9NZL4 362 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 TAGLN3Q9UI15 199 aa15.41■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 MUTP22033 750 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 GRIA2P42262 883 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHN2P52757 468 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 GTF2IP78347 998 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 BST1Q10588 318 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAXCQ5TGI0 409 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB107AQ8IZN7 70 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 POMGNT1Q8WZA1 660 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 GPRC5CQ9NQ84 441 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF180Q9UJW8 692 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 PIK3R2O00459 728 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 OATP04181 439 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 GLRA2P23416 452 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 GCAP28676 217 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 NFIXQ14938 502 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 HPS6Q86YV9 775 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 E2F7Q96AV8 911 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 MMP19Q99542 508 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 EBF4Q9BQW3 602 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 WWP1Q9H0M0 922 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAGEB2O15479 319 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 UQCRBP14927 111 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 MROH9Q5TGP6 573 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANO5Q75V66 913 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 FBXO11Q86XK2 927 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRN4Q8WUT4 740 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 CD101Q93033 1021 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa15.4■□□□□ 0.06
CCNDBP1-201ENST00000300213 TCF4P15884 667 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 RGS2P41220 211 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDE1BQ01064 536 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 LMNB2Q03252 620 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 NADK2Q4G0N4 442 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAL1Q4LDG9 190 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 SEMA4DQ92854 862 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 CSRNP1Q96S65 589 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 YIPF2Q9BWQ6 316 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 PFDN4Q9NQP4 134 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 PCSK1NQ9UHG2 260 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A0J9YVX5 310 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 TFPTP0C1Z6 253 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 GZMAP12544 262 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 NCKAP1LP55160 1127 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 HPCAP84074 193 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKRD22Q5VYY1 191 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM270Q6UE05 265 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 AIM2O14862 343 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 TYROBPO43914 113 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 GDF11O95390 407 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 FDX1P10109 184 aa15.39■□□□□ 0.05
CCNDBP1-201ENST00000300213 CIITAP33076 1130 aa15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms