RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 HOXA9P31269 272 aa23.22■■□□□ 1.31
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SLC25A39-201ENST00000225308 DUSP4Q13115 394 aa23.22■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 KRT31Q15323 416 aa23.22■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM171BQ6P995 826 aa23.22■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 SUSD6Q92537 303 aa23.22■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.22■■□□□ 1.31
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SLC25A39-201ENST00000225308 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 VWA3BQ502W6 1294 aa23.22■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 PPM1LQ5SGD2 360 aa23.22■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 GPR149Q86SP6 731 aa23.22■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 EHBP1Q8NDI1 1231 aa23.22■■□□□ 1.31
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SLC25A39-201ENST00000225308 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.22■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 PRKD2Q9BZL6 878 aa23.22■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 DOCK8Q8NF50 2099 aa23.21■■□□□ 1.31
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SLC25A39-201ENST00000225308 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 NDST1P52848 882 aa23.21■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 CUL2Q13617 745 aa23.21■■□□□ 1.31
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SLC25A39-201ENST00000225308 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa23.21■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 SPPL2BQ8TCT7 592 aa23.21■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 NT5C1BQ96P26 610 aa23.21■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.21■■□□□ 1.31
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SLC25A39-201ENST00000225308 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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SLC25A39-201ENST00000225308 HSFX1Q9UBD0 423 aa23.21■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa23.21■■□□□ 1.31
SLC25A39-201ENST00000225308 CILPO75339 1184 aa23.2■■□□□ 1.3
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SLC25A39-201ENST00000225308 TWNKQ96RR1 684 aa23.2■■□□□ 1.3
SLC25A39-201ENST00000225308 YIPF1Q9Y548 306 aa23.2■■□□□ 1.3
SLC25A39-201ENST00000225308 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa23.2■■□□□ 1.3
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SLC25A39-201ENST00000225308 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
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SLC25A39-201ENST00000225308 CYP2F1P24903 491 aa23.17■■□□□ 1.3
SLC25A39-201ENST00000225308 PON1P27169 355 aa23.17■■□□□ 1.3
SLC25A39-201ENST00000225308 APBA1Q02410 837 aa23.17■■□□□ 1.3
SLC25A39-201ENST00000225308 GCNT1Q02742 428 aa23.17■■□□□ 1.3
SLC25A39-201ENST00000225308 ATAT1Q5SQI0 421 aa23.17■■□□□ 1.3
SLC25A39-201ENST00000225308 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.17■■□□□ 1.3
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SLC25A39-201ENST00000225308 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
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