RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027351.12

Ccl20-201, Transcript of C-C motif chemokine 20, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl20, Length 1,417 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nmnat1Q9EPA7 285 aa8.33□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cacng4Q9JJV4 327 aa8.33□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Git2Q9JLQ2 708 aa8.33□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Homer2Q9QWW1 354 aa8.33□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 AmfrQ9R049 643 aa8.33□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm45861A0A1B0GRY3 1923 aa8.33□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Plxna3P70208 1872 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vsig10lD3YZF7 868 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Clca3bE9PUL3 1044 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 BC049352E9Q2Z6 85 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Aff1O88573 1216 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Idh1O88844 414 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Akap3O88987 864 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Itm2bO89051 266 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 P01878 344 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PrnpP04925 254 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PparaP23204 468 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Adssl1P28650 457 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cd22P35329 862 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Grin1P35438 938 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmc5Q32NZ6 967 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nat8lQ3UGX3 299 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Oog4Q4G0C7 502 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 H2-Q2Q4KN81 360 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ksr1Q61097 873 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 FdxrQ61578 494 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rad9bQ6WBX7 403 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tas2r124Q7M718 309 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 C2cd2lQ80X80 706 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 GnsQ8BFR4 544 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pnma2Q8BHK0 365 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PolrmtQ8BKF1 1207 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cep85Q8BMK0 761 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kank2Q8BX02 843 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ccdc113Q8C5T8 377 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gdpd3Q99LY2 330 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zfp623Q9CY99 499 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Coa3Q9D2R6 108 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fgf22Q9ESS2 162 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pex3Q9QXY9 372 aa8.32□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 SpegQ62407 3262 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm4756A0A140LIS8 335 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fibcd1A2AV25 459 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ppfia4B8QI36 1187 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Plekha5E9Q6H8 1269 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn2r78K7N6U5 853 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Efna5O08543 228 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ap1b1O35643 943 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fcn1O70165 334 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lin7bO88951 207 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dbx1P52950 335 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 ArntP53762 791 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PrkcbP68404 671 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Foxred2Q3USW5 665 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Wdr18Q4VBE8 431 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 DeptorQ570Y9 409 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Znf235Q61116 645 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cyp3a11Q64459 504 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Shkbp1Q6P7W2 704 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Casd1Q7TN73 797 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Akap7Q7TN79 314 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hapln4Q80WM4 400 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zbtb24Q80X44 710 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mapk15Q80Y86 549 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nod1Q8BHB0 953 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Plekhs1Q8BW88 474 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gpr158Q8C419 1200 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kct2Q8K201 259 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ablim1Q8K4G5 861 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc14a1Q8VHL0 384 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ino80bQ99PT3 375 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ndufaf7Q9CWG8 436 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mis18aQ9CZJ6 204 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gpn3Q9D3W4 284 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 MajinQ9D992 256 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Syde1Q9DBZ9 737 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Scyl1Q9EQC5 806 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Bscl2Q9Z2E9 383 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krt85Q9Z2T6 507 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dmxl1Q6PNC0 3013 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Znf318Q99PP2 2237 aa8.31□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem131O70472 1877 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm45194A0A140LJG2 572 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn2r121A2BE32 847 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 1700018F24RikB2RW27 314 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tgfbr3lD3YZZ2 297 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 TrdnE9Q9K5 693 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn2r111K7N674 857 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 EpoP07321 192 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pgap2Q3TQR0 254 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Q3UZV7 1028 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Adamts18Q4VC17 1219 aa8.3□□□□□ -1.08
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zp3rQ60736 579 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.1 ms