RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Crybg3Q80W49 1005 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spata20Q80YT5 790 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnali1Q8BVN8 258 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Agap1Q8BXK8 857 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Apol7cQ8C6E1 369 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 1700123K08RikQ9D991 295 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AvenQ9D9K3 342 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MycbpQ9EQS3 103 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hs6st3Q9QYK4 470 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dennd4aE9Q8V6 1869 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lonrf1D3YY23 762 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm5795E9PZN8 263 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 F6Y6L6 278 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnaseh1O70338 285 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aff1O88573 1216 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Casp14O89094 257 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ercc5P35689 1170 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnf157Q3TEL6 685 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cfhr2Q4LDF6 332 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tdrd5Q5VCS6 1040 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tdpoz4Q6YCH2 370 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gabbr2Q80T41 940 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wdr35Q8BND3 1181 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mbtps2Q8CHX6 515 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kct2Q8K201 259 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 BlmhQ8R016 455 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zkscan3Q91VW9 553 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcdhb1Q91Y08 818 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Katnbl1Q9CWJ3 299 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Orc1Q9Z1N2 840 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Speer2E9Q9U2 264 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pgk2P09041 417 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ces1cP23953 554 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rasgrf1P27671 1262 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 IppP28575 584 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tbxas1P36423 533 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gnl1P36916 607 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mxi1P50540 228 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Stmn1P54227 149 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nploc4P60670 608 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ugt1a2P70691 533 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnq1P97414 668 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GclcP97494 637 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Runx2Q08775 607 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cracr2aQ3UP38 310 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ugt1a1Q63886 535 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atl2Q6PA06 583 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam185aQ7TPD2 378 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Daam1Q8BPM0 1077 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trmt13Q8BYH3 481 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ythdf3Q8BYK6 585 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Taf5Q8C092 801 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Smtnl2Q8CI12 456 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Oit3Q8R4V5 546 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kdelr1Q99JH8 212 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zmat2Q9CPW7 199 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tdrd12Q9CWU0 1215 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Elp3Q9CZX0 547 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tekt1Q9DAJ2 418 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnajc12Q9R022 198 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cetn2Q9R1K9 172 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Myo16Q5DU14 1919 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r87E9PZX4 848 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Usp35M0QWN7 1009 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fgf15O35622 218 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tlk2O55047 718 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 IhhP97812 411 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zscan2Q07230 614 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ZbbxQ0P5X5 716 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GsapQ3TCV3 858 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atp13a5Q3TYU2 1216 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mpzl3Q3V3F6 237 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Itga1Q3V3R4 1179 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zdhhc18Q5Y5T2 380 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gba2Q69ZF3 918 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q80WR5 230 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q80ZQ3 298 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Orai2Q8BH10 250 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RpainQ9CWY9 219 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ebag9Q9D0V7 213 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Actn2Q9JI91 894 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp39a1Q9JKJ9 470 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Piwil1Q9JMB7 862 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Snx1Q9WV80 522 aa10.76□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cntnap5aQ0V8T9 1304 aa10.75□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp236S4R299 1847 aa10.75□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AspgA0JNU3 564 aa10.75□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc4a11A2AJN7 862 aa10.75□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm3371F7CQW8 167 aa10.75□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RarbP22605 482 aa10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.2 ms