RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025667.12

Rtn3-201, Transcript of Reticulon-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rtn3, Length 2,841 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gm4847G3X946 537 aa16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Pde9aO70628 534 aa16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Tmem63bQ3TWI9 832 aa16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Vps51Q3UVL4 782 aa16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gm732Q3V0P9 516 aa16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Myo19Q5SV80 963 aa16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Senp6Q6P7W0 1132 aa16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Tmem121Q80XA0 318 aa16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Nucks1Q80XU3 234 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Entpd3Q8BFW6 529 aa16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Sh2d5Q8JZW5 429 aa16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Q9CPS8 106 aa16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Utp11Q9CZJ1 253 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Ifrd2Q9D8U0 441 aa16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Lima1Q9ERG0 753 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Hey2Q9QUS4 339 aa16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa16.69■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Skor2A7M7C7 1008 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Sema4dO09126 861 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Serpini1O35684 410 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Serpina1aP07758 413 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Kcnn2P58390 839 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 SpoplQ2M2N2 392 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Ankrd13bQ5F259 626 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Herc4Q6PAV2 1057 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Fam185aQ7TPD2 378 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Znf365Q8BG89 408 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Olfm5Q8BU90 496 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Znf451Q8C0P7 1056 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Pop1Q8K205 1045 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Myoz3Q8R4E4 245 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Olfr807Q8VGI9 311 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Lman1Q9D0F3 517 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 AllcQ9JHX6 414 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Zscan4dA7KBS4 506 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Vwa5b1A9Z1V5 1215 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gm7535F7CXE4 302 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Eps15P42567 897 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 VdrP48281 422 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Mybl2P48972 704 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Serpina1dQ00897 413 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Ly9Q01965 654 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Dact3Q0PHV7 610 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Snx27Q3UHD6 539 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Zscan4fQ3URS2 506 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Tdrd5Q5VCS6 1040 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Zscan4cQ80VJ6 506 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Lyve1Q8BHC0 318 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 OgtQ8CGY8 1046 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Ces1Q8VCC2 565 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Ginm1Q91WR6 327 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Mov10l1Q99MV5 1187 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Rin2Q9D684 903 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Iqcf1Q9D9K8 182 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Pdpk1Q9Z2A0 559 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Lamb1P02469 1786 aa16.68■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Zfp626A0A0U1RQ84 676 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Wdr95D3Z7A8 784 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gm340F6RGI3 1242 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 AgxtO35423 414 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Kcna1P16388 495 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Cdc25bP30306 576 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Drd4P51436 387 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Frg1P97376 258 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Zbtb14Q08376 449 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Mdh1bQ5F204 500 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Bend6Q6PFX2 281 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Dlg1Q811D0 905 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Ttc4Q8R3H9 386 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Hdhd5Q91WM2 419 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Lyrm1Q9CQB7 122 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 RnmtQ9D0L8 465 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Phkg2Q9DB30 406 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Pde8bE9Q4S1 865 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gm10639E9Q6L7 222 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gsta2P10648 222 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Tgfb3P17125 410 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Marcksl1P28667 200 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 YwhagP61982 247 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Kcnj8P97794 424 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Hdgfl2Q3UMU9 669 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Akap7Q7TN79 314 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Ube3cQ80U95 1083 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Fam118bQ8C569 351 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Snapc2Q91XA5 359 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Tcaf2Q921K8 919 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Plpp6Q9D4F2 292 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Kat2bQ9JHD1 813 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Tgm1Q9JLF6 815 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Tnks1bp1P58871 1720 aa16.67■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gm7356A0A087WSA6 508 aa16.66■□□□□ 0.26
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Krt19P19001 403 aa16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.7 ms