RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN4	YMR138W	NCE103	P53615	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	ADD37	Q03233	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	CTR3	Q06686	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	AYT1	Q12226	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	SFT2	P38166	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	AIM24	P47127	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	ATG39	Q06159	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	LDS2	Q08218	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	ELO2	P25358	347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	LDS1	P31379	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	MSK1	P32048	576 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	YBR144C	P34215	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	PTC7	P38797	343 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	ATG27	P46989	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	SNN1	P48232	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	PAU4	P53427	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	YNR071C	P53757	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	ATC1	Q04005	294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	SNF11	P38956	169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	DSK2	P48510	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	MRX11	Q03079	207 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	VPS71	Q03433	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	ATX2	Q12067	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	PAU13	P38725	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	MPC2	P38857	129 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	COX18	P53239	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	PAU10	Q03050	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	PAU20	Q08322	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	COX2	P00410	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
CIN4	YMR138W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	YIL024C	P40543	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	GNP1	P48813	663 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	ORM2	Q06144	216 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	FIT2	Q08906	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	ERV2	Q12284	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	MRS1	P07266	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	ECM25	P32525	599 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	AFR1	P33304	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	TRS20	P38334	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	PHS1	P40857	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	TDA4	P47153	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	CAX4	P53223	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	MIG1	P27705	504 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	SRB6	P32570	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	RTG1	P32607	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	SDH4	P37298	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	YHR173C	P38864	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	CYB5	P40312	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	GPI2	P46961	280 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	LCB3	P47013	409 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	UBC7	Q02159	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	ISU1	Q03020	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	IZH1	Q03419	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	IZH3	Q07959	543 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	MDM10	P18409	493 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	TIR2	P33890	251 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	SPI1	P40092	148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	YIL077C	P40508	320 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	YDR274C	P87283	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIN4	YMR138W	SEC59	P20048	519 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIN4	YMR138W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CIN4	YMR138W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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