RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	ECM5	Q03214	1411 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	YHR022C	P38763	256 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	RAD28	Q12021	506 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	SPC3	Q12133	184 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	SLO1	Q3E784	85 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
RPS0B	YLR048W	GAA1	P39012	614 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	APS3	P47064	194 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	YNR064C	P53750	290 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	CYT2	Q00873	224 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	EST3	Q03096	181 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	RIM9	Q04734	239 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	RNH202	Q05635	350 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	YPR013C	Q12145	317 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	FCY1	Q12178	158 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	SEC11	P15367	167 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	PAC10	P48363	199 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	SAY1	P53324	424 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	SDH7	Q04401	133 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	NKP2	Q06162	153 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	FRQ1	Q06389	190 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	YOR015W	Q12169	119 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	MET5	P47169	1442 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	GPA2	P10823	449 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	AHT1	P29589	182 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	TFC1	P32367	649 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	YHR140W	P38842	239 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	KNH1	P50112	268 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	PIR1	Q03178	341 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	DML1	Q03652	475 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	MIX17	Q03667	156 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	YPR114W	Q06107	315 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	ATG10	Q07879	167 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	DDI2	P0CH63	225 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	DDI3	P0CH64	225 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	AYR1	P40471	297 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	YNL019C	P53975	284 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	ANT1	Q06497	328 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	RRT7	Q07829	113 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	YOL162W	P0CF19	215 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	HRT1	Q08273	121 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	UIP4	Q08926	304 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS0B	YLR048W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	MRS4	P23500	304 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	MRP49	P32388	137 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	VMA7	P39111	118 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	GEP7	P53171	287 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	BUD25	P85052	153 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	UPS3	Q04006	179 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	HYM1	P32464	399 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	TRS20	P38334	175 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	NSE4	P43124	402 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	YGR017W	P53210	297 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	DAD4	P69851	72 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	ATG41	Q12048	136 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	MSB2	P32334	1306 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	DSE2	P38844	325 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	YHP1	Q04116	353 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	SML1	Q04964	104 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	UPS1	Q05776	175 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	COX8	P04039	78 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	MOB1	P40484	314 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	YML079W	Q03629	201 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	BOL1	Q3E793	110 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	SPS2	P08459	502 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	MDH2	P22133	377 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	EMC4	P53073	190 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	INO4	P13902	151 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	MAK31	P23059	88 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	UTR5	P32630	166 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	YEL067C	P39978	195 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	HPM1	P40481	377 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	SFT1	P43682	97 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	SPG1	P50088	95 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	CSI2	Q08054	341 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	SCS22	Q6Q595	175 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPS0B	YLR048W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	ATP19	P81451	68 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	FIT2	Q08906	153 aa		3.02	□□□□□ -1.93

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