RNA–Protein interactions for RNA: YFL007W

BLM10, Transcript of Proteasome activator, yeast

Gene BLM10, Length 6,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLM10	YFL007W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YFR054C	P43622	192 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	ODC2	Q99297	307 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	SNM1	P40993	198 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	GRX8	Q05926	109 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	ATG40	Q99325	256 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	DCW1	P36091	449 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	MBB1	P39534	108 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	TAX4	P47030	604 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	IRC13	Q08630	104 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	GPI18	P38211	433 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YCH1	P42937	148 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YJL118W	P47022	219 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	KRE1	P17260	313 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	FRM2	P37261	193 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	PRM5	P40476	318 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	UBC5	P15732	148 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	ATS1	P31386	333 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	ENV10	Q99382	181 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
BLM10	YFL007W	SDS23	P53172	527 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	PHS1	P40857	217 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	CDD1	Q06549	142 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	OPI3	P05375	206 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	SAS2	P40963	338 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	MIC27	P50945	234 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	GAS3	Q03655	524 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	HRT1	Q08273	121 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	PCL9	Q12477	304 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	QRI5	P32344	111 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	MSN2	P33748	704 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	MCH4	Q08268	501 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	PAU16	P35994	123 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	EGT2	P42835	1041 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BLM10	YFL007W	MAK32	P23060	363 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	NSG2	P53898	299 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	UTR5	P32630	166 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	YNL217W	P40152	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	YNL046W	P53956	172 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	FLO10	P36170	1169 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	PRY1	P47032	299 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	YCR050C	P25630	102 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	ASK1	P35734	292 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	YHL042W	P38729	150 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	YER188W	P40103	239 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	DIC1	Q06143	298 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	SNA4	Q07549	140 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	MSA1	Q08471	629 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	SWS2	P53937	143 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	TEN1	Q07921	160 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	COX5A	P00424	153 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	Q0255	P03881	472 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	SFT1	P43682	97 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	YIP5	P53108	310 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	YHR140W	P38842	239 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	ECO1	P43605	281 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	SNA2	P56508	79 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	APC1	P53886	1748 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	CDC1	P40986	491 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BLM10	YFL007W	UBP8	P50102	471 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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