RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHO1	YER118C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	ECM34	P38728	170 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	YHL026C	P38740	315 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	YHR125W	P38831	101 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	YGL193C	P53097	103 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	COX4	P04037	155 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
SHO1	YER118C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
SHO1	YER118C	SFT1	P43682	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	AIF1	P52923	378 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	AIM11	P87275	137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	MCH1	Q07376	486 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	TIM9	O74700	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	PCL1	P24867	279 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	YBL010C	P32788	280 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	TMA23	Q03525	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	SCW10	Q04951	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	CAT8	P39113	1433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	MET5	P47169	1442 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHO1	YER118C	NUP159	P40477	1460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	DSK2	P48510	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	ATO3	Q12359	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	ODC2	Q99297	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	VPS15	P22219	1454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	MRPL17	P36528	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	YBR220C	P38318	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	BUD25	P85052	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	VPS28	Q02767	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	YDR391C	Q04170	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	PDR12	Q02785	1511 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	NTE1	Q04958	1679 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	AHT1	P29589	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	YDR274C	P87283	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	YML122C	Q03207	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	GAL83	Q04739	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	FYV12	Q08559	129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	RAD10	P06838	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	KRE9	P39005	276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	EST3	Q03096	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	YER188W	P40103	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	ECO1	P43605	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	MRPS8	Q03799	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	YBT1	P32386	1661 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	PDR10	P51533	1564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHO1	YER118C	UMP1	P38293	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	CTR2	P38865	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	SBH1	P52870	82 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	SYM1	Q06563	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	AUS1	Q08409	1394 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	SRB8	P25648	1427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	GDB1	Q06625	1536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	YEL028W	P39989	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	YNR062C	P53748	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	TRM3	Q07527	1436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	RAD6	P06104	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	ATP20	Q12233	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	SPO14	P36126	1683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	SPS2	P08459	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	YOR062C	P36025	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	ETR1	P38071	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	GON7	P46984	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	EMC4	P53073	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	GEP7	P53171	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	YGR026W	P53217	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	ELC1	Q03071	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHO1	YER118C	TVP18	Q04767	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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