RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 CEP55Q53EZ4 464 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 MON1BQ7L1V2 547 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 NLRX1Q86UT6 975 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 ALLCQ8N6M5 410 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 TSSK1BQ9BXA7 367 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 PRR12Q9ULL5 1215 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 UTRNP46939 3433 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 LYNP07948 512 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 GSTT1P30711 240 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 DSG3P32926 999 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 MSS51Q4VC12 460 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.58■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 RARBP10826 455 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 PSMC4P43686 418 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB16Q05516 673 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 PPFIBP2Q8ND30 876 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 GBP5Q96PP8 586 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ZNF212Q9UDV6 495 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 E5RJQ4 531 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 DLDP09622 509 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 PEX3P56589 373 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 BANPQ8N9N5 519 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 EXD1Q8NHP7 514 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 GMCL1Q96IK5 515 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 PAFAH2Q99487 392 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 NMUR2Q9GZQ4 415 aa21.57■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 DENND3A2RUS2 1198 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 GTF2BQ00403 316 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 MFSD7Q6UXD7 560 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 CEP128Q6ZU80 1094 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 SV2AQ7L0J3 742 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 BICD1Q96G01 975 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 FAM161BQ96MY7 647 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 DNAJC6O75061 913 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 NSFP46459 744 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 MORF4L2Q15014 288 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 CNPY1Q3B7I2 92 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD22Q5VYY1 191 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 IZUMO2Q6UXV1 221 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 CLPTM1LQ96KA5 538 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 IWS1Q96ST2 819 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 TMEM121Q9BTD3 319 aa21.56■■□□□ 1.04
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PMS1-222ENST00000639501 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 C10orf88Q9H8K7 445 aa21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 FCHO1O14526 889 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 USP1O94782 785 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 PGM1P36871 562 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 RARRES1P49788 294 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ARL4CP56559 192 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 MAMLD1Q13495 774 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 CRY2Q49AN0 593 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 CENPUQ71F23 418 aa21.55■■□□□ 1.04
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PMS1-222ENST00000639501 FAM81BQ96LP2 452 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 PDP2Q9P2J9 529 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 IFNB1P01574 187 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 MYL2P10916 166 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 BGNP21810 368 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 RASA2Q15283 850 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 FNBP1LQ5T0N5 605 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 CCDC174Q6PII3 467 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 SLITRK1Q96PX8 696 aa21.55■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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PMS1-222ENST00000639501 TREML1Q86YW5 311 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 H3BRJ5 948 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ALCAMQ13740 583 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-222ENST00000639501 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.54■■□□□ 1.04
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