RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622090.4

DDB2-215, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, human

TSL 5

Gene DDB2, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB2-215	ENST00000622090	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	ASB3	Q9Y575	518 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	MCF2	P10911	925 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	ENG	P17813	658 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	KRT2	P35908	639 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	SEMA3B	Q13214	749 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	PTPA	Q15257	358 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	ANO7	Q6IWH7	933 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	IFT74	Q96LB3	600 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
DDB2-215	ENST00000622090	OR6C75	A6NL08	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	FGF19	O95750	216 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	PSMA5	P28066	241 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	PTGER3	P43115	390 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	NPTX2	P47972	431 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	PEX3	P56589	373 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	SCAP	Q12770	1279 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	PSMD2	Q13200	908 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	RASSF3	Q86WH2	238 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	DAW1	Q8N136	415 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	GIPC2	Q8TF65	315 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	RLN3	Q8WXF3	142 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	CCDC169	A6NNP5	214 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	F11	P03951	625 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	CXCL8	P10145	99 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	RPA1	P27694	616 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	CDC25C	P30307	473 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	LRPAP1	P30533	357 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	FBXO43	Q4G163	708 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	SLC32A1	Q9H598	525 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	XBP1	P17861	261 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	SEC13	P55735	322 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	NLRP12	P59046	1061 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	ZBTB6	Q15916	424 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	USP37	Q86T82	979 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	ADAM32	Q8TC27	787 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	USP33	Q8TEY7	942 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	CD101	Q93033	1021 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	ACD	Q96AP0	544 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	TDP1	Q9NUW8	608 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090		K7EQS6	105 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	TADA3	O75528	432 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	SEC24B	O95487	1268 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	MCM7	P33993	719 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	AVPR1A	P37288	418 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	TNFSF9	P41273	254 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	GPR15	P49685	360 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDB2-215	ENST00000622090	FOSB	P53539	338 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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