RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617204.4

MAP7-208, Transcript of microtubule associated protein 7, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene MAP7, Length 4,536 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MAP7-208	ENST00000617204	VPS72	Q15906	364 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	ACTL9	Q8TC94	416 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	KRT38	O76015	456 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	KRT76	Q01546	638 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	SLC34A1	Q06495	639 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	MORF4L2	Q15014	288 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	RNF220	Q5VTB9	566 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	GMCL1	Q96IK5	515 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MAP7-208	ENST00000617204	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		13.4	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.4	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	FCHO1	O14526	889 aa		13.4	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	CDH6	P55285	790 aa		13.4	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	NCOA4	Q13772	614 aa		13.4	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.4	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	HIC1	Q14526	733 aa		13.4	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	CHI3L2	Q15782	390 aa		13.4	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		13.4	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		13.4	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	E2F8	A0AVK6	867 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	KRT7	P08729	469 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	SPATA18	Q8TC71	538 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	EDIL3	O43854	480 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	PRPSAP2	O60256	369 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	PSAP	P07602	524 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	NPR1	P16066	1061 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	ROR1	Q01973	937 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204		F8VP50	259 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	NFIB	O00712	420 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	ASPH	Q12797	758 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	CUL2	Q13617	745 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	MROH9	Q5TGP6	573 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	LENG9	Q96B70	501 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	COX16	Q9P0S2	106 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	CREB3	O43889	395 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	MED21	Q13503	144 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	TRIP10	Q15642	601 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	PARP6	Q2NL67	630 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	MYH1	P12882	1939 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	TPBGL	P0DKB5	382 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	CETP	P11597	493 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	ADRA2B	P18089	450 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MAP7-208	ENST00000617204	BMPR2	Q13873	1038 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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