RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616702.1

CCL3L3-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 2

Gene CCL3L3, Length 548 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-202ENST00000616702 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 FNBP1Q96RU3 617 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 EXOC1Q9NV70 894 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 UBE4BO95155 1302 aa14.64□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 SYKP43405 635 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 MRE11P49959 708 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 EPHA5P54756 1037 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 MYL7Q01449 175 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 SMARCB1Q12824 385 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 GRM2Q14416 872 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 BECN1Q14457 450 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 VEPH1Q14D04 833 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 WDR49Q8IV35 697 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 SMARCD2Q92925 531 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 PSMG2Q969U7 264 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 HPDLQ96IR7 371 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 PHOX2BQ99453 314 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 LPIN3Q9BQK8 851 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 GPR88Q9GZN0 384 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 USP25Q9UHP3 1055 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 SIX4Q9UIU6 781 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 L1RE1Q9UN81 338 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 ASB3Q9Y575 518 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 PTPRJQ12913 1337 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 MYO10Q9HD67 2058 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 EXOC3O60645 756 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 MOSPD3O75425 235 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 STK4Q13043 487 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 TMC8Q8IU68 726 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 CXorf38Q8TB03 319 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 GIPC2Q8TF65 315 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 ASB16Q96NS5 453 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 ACBD6Q9BR61 282 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 FOXQ1Q9C009 403 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 BRD9Q9H8M2 597 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 KLRC4O43908 158 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 CLSTN1O94985 981 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 FGF19O95750 216 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 FCARP24071 287 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 GABRR2P28476 465 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 VIPR2P41587 438 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 LHX1P48742 406 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 NDUFA8P51970 172 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 STARD6P59095 220 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 PSMD6Q15008 389 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 GCNAQ96QF7 691 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 MMS19Q96T76 1030 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 LRRC3Q9BY71 257 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 HPSEQ9Y251 543 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 KANSL1LA0AUZ9 987 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 PSMC3P17980 439 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL3L3-202ENST00000616702 ATF6P18850 670 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms