RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612161.4

SLC38A1-211, Transcript of solute carrier family 38 member 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC38A1, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A1-211ENST00000612161 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 USP38Q8NB14 1042 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 TSPEARQ8WU66 669 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 RABGGTAQ92696 567 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 NRBF2Q96F24 287 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 COG3Q96JB2 828 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 CCT7Q99832 543 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 GPR108Q9NPR9 543 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 HESX1Q9UBX0 185 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ABCA6Q8N139 1617 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 NCOA1Q15788 1441 aa6.7□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 A0A087X0M5 115 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 A0A1B0GX30 115 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 TMEM247A6NEH6 219 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 COBLO75128 1261 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 CAVIN2O95810 425 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 PCP11498 1178 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 CNTFP26441 200 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 PRKAR2BP31323 418 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 SERPINF1P36955 418 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ITGA8P53708 1063 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 KRT83P78385 493 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 DSC2Q02487 901 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 KCNB1Q14721 858 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 SPCS2Q15005 226 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 PLCB4Q15147 1175 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 GGT6Q6P531 493 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 IL31RAQ8NI17 732 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 SMC6Q96SB8 1091 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 HDAC8Q9BY41 377 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 TRIM5Q9C035 493 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 TRIM17Q9Y577 477 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 USP19O94966 1318 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 F8W8V4 182 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 MYO1FO00160 1098 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 SCDO00767 359 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 MCF2LO15068 1137 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ALBP02768 609 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 TUBB4AP04350 444 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 GNAT1P11488 350 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ATP1A3P13637 1013 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 RAC2P15153 192 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 KRT20P35900 424 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 MAN2A2P49641 1150 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 TUBP50607 506 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 CBX3Q13185 183 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 SP140Q13342 867 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 MEA1Q16626 185 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 NEPROQ6NW34 567 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 NME9Q86XW9 330 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 CEP112Q8N8E3 955 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 RGMAQ96B86 450 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC38A1-211ENST00000612161 ZNF653Q96CK0 615 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms