RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606671.5

ZEB1-225, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 4

Gene ZEB1, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-225	ENST00000606671	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	REST	Q13127	1097 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	FOXE3	Q13461	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	GPR20	Q99678	358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	NCAN	O14594	1321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	WDR97	A6NE52	1622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671		A0A1W2PS29	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TOR1B	O14657	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	PRRG2	O14669	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	DCLK1	O15075	740 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	CDKL5	O76039	1030 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	LAG3	P18627	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TM4SF4	P48230	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	CASP5	P51878	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	RAB32	Q13637	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	SOGA1	O94964	1423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	SPDEF	O95238	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	PEX11B	O96011	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	BMPR1A	P36894	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	ZNF134	P52741	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	MXRA7	P84157	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	SYNJ2	O15056	1496 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671		E7ENX8	843 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-225	ENST00000606671	MYO1C	O00159	1063 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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