RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 MCL1Q07820 350 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP17.39■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 MYBPC2Q14324 1141 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 SLC39A12Q504Y0 691 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 USP37Q86T82 979 aa17.39■□□□□ 0.37
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PTPRS-208ENST00000590509 DEFB124Q8NES8 71 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 SENP8Q96LD8 212 aa17.39■□□□□ 0.37
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PTPRS-208ENST00000590509 TADA3O75528 432 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 F11P03951 625 aa17.38■□□□□ 0.37
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PTPRS-208ENST00000590509 GJA4P35212 333 aa17.38■□□□□ 0.37
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PTPRS-208ENST00000590509 TMLHEQ9NVH6 421 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 TBX20Q9UMR3 447 aa17.38■□□□□ 0.37
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PTPRS-208ENST00000590509 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP17.37■□□□□ 0.37
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PTPRS-208ENST00000590509 TTC38Q5R3I4 469 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 HAUS3Q68CZ6 603 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 PMS2CLQ68D20 193 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 SCARA3Q6AZY7 606 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 LRSAM1Q6UWE0 723 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 FRMD1Q8N878 549 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 IGSF22Q8N9C0 903 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 SLC22A12Q96S37 553 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 KLK13Q9UKR3 277 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
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PTPRS-208ENST00000590509 EBF1Q9UH73 591 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 LHX6Q9UPM6 363 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
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PTPRS-208ENST00000590509 APBB3O95704 486 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 NFICP08651 508 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 CLTAP09496 248 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 CEACAM1P13688 526 aa17.35■□□□□ 0.37
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PTPRS-208ENST00000590509 ADRB2P07550 413 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 DRD1P21728 446 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 MESP2Q0VG99 397 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 TRIM29Q14134 588 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 ARMCX5Q6P1M9 558 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 ZPBP2Q6X784 338 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRS-208ENST00000590509 SPIRE2Q8WWL2 714 aa17.34■□□□□ 0.37
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