RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589363.5

SLC39A3-205, Transcript of solute carrier family 39 member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SLC39A3, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3-205ENST00000589363 CUTAO60888 179 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 CDC25CP30307 473 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 MYL7Q01449 175 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 GAREM2Q75VX8 874 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 IQUBQ8NA54 791 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 HPS3Q969F9 1004 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 CUEDC2Q9H467 287 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 YEATS4O95619 227 aa20.67■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 TNNC2P02585 160 aa20.67■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 ATF6P18850 670 aa20.67■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 CCNE1P24864 410 aa20.67■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 RBP5P82980 135 aa20.67■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.67■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 FAM84AQ96KN4 292 aa20.67■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.67■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.67■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 ZNF233A6NK53 670 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 ME1P48163 572 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 TSSK4Q6SA08 328 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 TTC8Q8TAM2 541 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 SNX21Q969T3 373 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 CLDN23Q96B33 292 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 BORCS6Q96GS4 357 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 TRIM9Q9C026 710 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 TASP1Q9H6P5 420 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 LMAN1LQ9HAT1 526 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 L1RE1Q9UN81 338 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 NCANO14594 1321 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 PATJQ8NI35 1801 aa20.65■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 CHADO15335 359 aa20.65■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 MYO1EQ12965 1108 aa20.65■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 PPP2R5DQ14738 602 aa20.65■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 SURF1Q15526 300 aa20.65■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.65■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.65■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.65■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.65■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.65■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.65■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 USP34Q70CQ2 3546 aa20.65■□□□□ 0.9
SLC39A3-205ENST00000589363 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 CLSTN1O94985 981 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 MTAPQ13126 283 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 SHC4Q6S5L8 630 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 RDH13Q8NBN7 331 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 TTC16Q8NEE8 873 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 PRAMEF12O95522 483 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 F13A1P00488 732 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 PCSK1P29120 753 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 AVPR1AP37288 418 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 SOX9P48436 509 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 GPR15P49685 360 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 CYP2J2P51589 502 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 E2F4Q16254 413 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 STKLD1Q8NE28 680 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 RUBCNQ92622 972 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 MSANTD3Q96H12 275 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 FNBP1Q96RU3 617 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 ACBD6Q9BR61 282 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3-205ENST00000589363 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms