RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 GRIK3Q13003 919 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 KYAT1Q16773 422 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF699Q32M78 642 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ABI1Q8IZP0 508 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 URGCPQ8TCY9 931 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 HERVK_113Q902F9 699 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TOP1MTQ969P6 601 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 HPDLQ96IR7 371 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NT5C1BQ96P26 610 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TWNKQ96RR1 684 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR88Q9GZN0 384 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CWH43Q9H720 699 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MARCH5Q9NX47 278 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 COQ4Q9Y3A0 265 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 C2CD2Q9Y426 696 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TSC2P49815 1807 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CENPFP49454 3210 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PQC6 194 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 KRBA1A5PL33 1030 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PIRO00625 290 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 NRP1O14786 923 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP2C2O75185 946 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 B3GAT3O94766 335 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GFPT2O94808 682 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT5P13647 590 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 UCHL3P15374 230 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFV2P19404 249 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CDC25BP30305 580 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 LRPAP1P30533 357 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF2H1P32780 548 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 DEKP35659 375 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ASPAP45381 313 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RBP5P82980 135 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 DSC1Q08554 894 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TUSC3Q13454 348 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CUL2Q13617 745 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 MTF1Q14872 753 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 UPP1Q16831 310 aa6.46□□□□□ -1.38
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CAPNS1-208ENST00000589162 WDR44Q5JSH3 913 aa6.46□□□□□ -1.38
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CAPNS1-208ENST00000589162 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 WSCD1Q658N2 575 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PDXDC1Q6P996 788 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CD302Q8IX05 232 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TC2NQ8N9U0 490 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF217Q8TC41 542 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.46□□□□□ -1.38
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CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM209Q96SK2 561 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 MMS19Q96T76 1030 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 YME1L1Q96TA2 773 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GDF15Q99988 308 aa6.46□□□□□ -1.38
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CAPNS1-208ENST00000589162 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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CAPNS1-208ENST00000589162 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CERS4Q9HA82 394 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.46□□□□□ -1.38
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CAPNS1-208ENST00000589162 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 L1RE1Q9UN81 338 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 DERAQ9Y315 318 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.46□□□□□ -1.38
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